Cancer Res泛癌分析重磅揭示:通常在睾丸中表达的FOXR2基因,至少在70%癌症类型中被异常激活! 白云 科研 2022-08-09 该研究全面绘制了不同癌症的FOXR2表达图谱,发现在成人和儿童癌症的所有癌症谱系中,至少有70%存在异常激活。
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Nature Methods | 自由探索4D核组数据——马坚团队发布Nucleome Browser平台 白云 科研 2022-08-09 Nucleome Browser可为用户充分利用不同类型的4D核组数据和不同的3D表观基因组学数据集在广泛的生物环境中融合多尺度核结构和功能提供重要门户,从而实现模型整合和广泛的数据共享社区。
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Cancer Cell | 基于949种人类癌细胞系绘制泛癌蛋白质组图谱,揭示数千种癌症易感性蛋白质生物标志物 白云 科研 2022-08-09 ProCan-DepMap Sanger是一个大型泛癌蛋白质组图谱,提供了超越现有分子数据集的多种见解。该图谱量化了949种人类癌细胞系中的8498种蛋白质,代表28种组织和40多种组织学上不同的癌症类型和广泛的基因型,显著扩展了癌…
Cancer Cell | 基于949种人类癌细胞系绘制泛癌蛋白质组图谱,揭示数千种癌症易感性蛋白质生物标志物 白云 科研 2022-08-09 ProCan-DepMap Sanger是一个大型泛癌蛋白质组图谱,提供了超越现有分子数据集的多种见解。该图谱量化了949种人类癌细胞系中的8498种蛋白质,代表28种组织和40多种组织学上不同的癌症类型和广泛的基因型,显著扩展了癌…
Nature Genetics | DeepLoop:利用低深度Hi-C数据绘制人类基因组等位基因特异性染色质互作图谱 白云 科研 2022-08-01 研究团队开发了DeepLoop,执行严格的偏差校正,通过基于深度学习的信号增强,从低深度Hi-C数据中实现稳健的染色质相互作用映射。DeepLoop可以实现环路分辨率、单细胞Hi-C分析,还能实现不同Hi-C协议和micro-C之间…
Nature Genetics | DeepLoop:利用低深度Hi-C数据绘制人类基因组等位基因特异性染色质互作图谱 白云 科研 2022-08-01 研究团队开发了DeepLoop,执行严格的偏差校正,通过基于深度学习的信号增强,从低深度Hi-C数据中实现稳健的染色质相互作用映射。DeepLoop可以实现环路分辨率、单细胞Hi-C分析,还能实现不同Hi-C协议和micro-C之间…
Nature Cancer观点 | 肿瘤突变负荷与免疫治疗的现状 白云 科研 2022-08-01 近年来,肿瘤突变负荷(TMB)在免疫检查点抑制剂反应的生物标志物研究中受到了极大关注。2020年6月,美国FDA批准抗PD-1治疗药物帕博利珠单抗(Keytruda)的第二项“不限癌种”适应症,用于治疗组织肿瘤高突变负荷(TMB-H…
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J CLIN MICROBIOL | 新型低成本、高通量基因分型工具可快速识别新冠病毒变异毒株 白云 科研 2022-08-01 研究团队还开发了一种包含四种高度特异性SNP突变的基因分型工具,用于识别新冠毒株Omicron和Dela,该毒株SNP基因分型工具以及相关的统计数据均可在公开数据库中获得( https://tracker.rosalind.bio/…
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学术成果 | 多中心真实世界研究:基于血浆ctDNA突变的转移性乳腺癌亚型临床分析 白云 科研 2022-07-26 该研究旨在强调ctDNA监测可以作为一种有用的技术手段提供全面的分子信息,指导后线转移性乳腺癌的药物治疗。
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Nat Commun | 利用superRCA突变检测方法对AML患者进行复发早期的超敏感监测 白云 科研 2022-07-26 该研究团队在此描述了一种高敏感度和选择性的分子扩增技术——superRRCA分析,用于快速和高度特异地检测肿瘤样本中的低频基因突变。
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王鹏远/鲁志/徐振江团队合作发表泛癌早诊研究新成果:利用血浆中人源+微生物源cfRNA诊断早期癌症及其组织来源 白云 科研 2022-07-26 该研究发现了血浆中人源和微生物源的cfRNA具有临床相关性,可用作诊断癌症及判断肿瘤来源类型的生物标记物,具有很好的临床应用前景。
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Nature Genetics | 单细胞转录组测序鉴定两种新的上皮肿瘤细胞类型,定义更精准的CRC分类体系IMF 白云 科研 2022-07-26 在恶性上皮细胞中,通过对单细胞转录组表达、调控和推断拷贝数图谱的独立分析,鉴定出两种不同的亚型iCMS2和iCMS3,并通过进一步研究提出CRC分类的细化层级,即内源性上皮亚型、微卫星不稳定状态和纤维化。
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