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2025年值得关注的空间组学公司:更多突破,更多可能

空间组学是人类基因组计划后时代的一项新兴技术,打破了传统组学技术的空间信息局限,为生命科学和医学研究提供了更全面、更精准的工具,为一系列以前未探索的生命现象提供了独特的生物学见解。

近日,国外生物医药领域知名媒体GEN经过筛选发布了2025年值得关注的十大空间组学公司名单。数据显示,空间生物学领域前五大上市公司的营收同比增长9%,从2023年1月至2024年6月的31.16亿美元增至2024年1月至6月的33.98亿美元。与2024年上市公司21%的增长相比,目前企业的年增长率已大幅下降(2022年1月至2023年6月期间,榜单上市公司的总收入约为26.12亿美元)。2025年五大私营企业融资总额同比增长8%,从2024年的5.91亿美元增至6.4亿美元以上,较2023年的5.115亿美元飙升15.5%。

需要注意的是,该榜单中上市公司按照其2024年全年及2025年上半年合并营收进行排名,所有数据均来自监管披露文件,涵盖产品或服务销售收入,以及合作项目和研发活动产生的收入。私营企业则依据公开披露的融资总额排序,相关数据来自公开报道。

一、上市公司

1.Bruker

BSI Nano事业部,包括Bruker Spatial Biology

营收:2025年第一、二季度:5.087亿美元;2024年全年:10.98亿美元

在2025年4月举行的美国癌症研究协会(AACR)年会上,Bruker Spatial Biology 发布了一系列新技术,包括:用于全转录组亚细胞空间成像的CosMx WTX检测、用于单细胞三维基因组结构和染色体结构可视化的PaintScape™平台、用于在CellScape™平台实现空间蛋白组学高效分析流程自动化的PowerOMX™引擎,以及应用于GeoMx® DSP平台的1200 plex蛋白panel。BSI Nano事业部在第二季度实现营收2.521亿美元,较2024年同期的2.525亿美元下降0.2%。

2.10x Genomics

营收:2025年第一、二季度为3.27791亿美元;2024年为6.1078.5亿美元

10x Genomics于2025年8月通过推出Xenium Protein扩大了其空间组学版图。Xenium Protein是Xenium Spatial平台的新增模块,以实现在同一细胞、同一组织切片的单次全自动检测流程中,同步完成RNA与蛋白的检测。5月,10x Genomics裁减了8%的员工岗位(约100人),作为削减5,000万美元成本以及应对美国联邦削减学术研究资金带来的不确定性措施的一部分。此外,10x Genomics与Bruker和Vizgen就专利侵权诉讼达成和解。其中,Bruker同意向10x支付6,800万美元并支付后续特许权使用费。

3.Bio-Techne (诊断与空间生物学事业部)

营收:截至2025年6月30日为3.46263亿美元;2024年1–6月为1.78188亿美元

Bio-Techne于2025年4月宣布推出其最新空间生物学技术的早期体验计划,该技术是一种用于原位检测蛋白质邻近性的新型检测方法。据悉,这款新一代检测技术建立在Advanced Cell Diagnostics(ACD)RNAscope™技术基础之上,其设计目的在于通过揭示完整组织中蛋白质间的功能相互作用,提供真正意义上的、集成化的空间多组学视图。此外,Bio-Techne与Leica Biosystems扩展了他们的空间多组学合作,包括在Leica的BOND RX科研染色平台实现ACD新一代RNAscope™ Multiomic LS检测方法及无蛋白酶工作流程的自动化运行。2月,Bio-Techne推出了种类更加丰富的人和小鼠RNAscope原位杂交探针产品,旨在推动空间组学的研究发展,并促进治疗药物及诊断技术开发。

4.Standard BioTools

营收:2025年第一、第二季度为4198.4万美元;2024年为1.74432亿美元

在与数据驱动蛋白质组学技术领导者SomaLogic合并18个月后,Standard BioTools宣布将SomaLogic以最高4.25亿美元(其中3.5亿美元预付款)出售给Illumina,该交易预计于2026年上半年完成。Standard表示,这笔交易将帮助其实现一个关键优先事项,即在利息、税项、折旧和摊销前调整后的盈亏平衡(EBITDA),并简化运营和组织基础设施,以便更专注于空间、单细胞和多组学产品。其中包括Hyperion™ XTi成像系统,这是一种用于空间蛋白质组学的质谱流式细胞仪,该技术已在发表于《Nature》的研究中获得重要展示。

5.Quanterix(包括Akoya Biosciences

营收:2025年第一、二季度约3000万美元;2024年全年8170万美元

Quanterix是一家专注于超灵敏生物标志物检测的公司,于2025年7月完成了对Akoya Biosciences的收购,该交易旨在构建首个覆盖血液和组织样本的超灵敏蛋白质生物标志物综合检测解决方案平台。Quanterix为此发行了约780万股普通股,并向Akoya的股东及其他权益持有人支付约2,000万美元现金。Quanterix认为,通过打造更全面的疾病检测平台,公司的潜在市场规模已从10亿美元翻了五倍,激增至50亿美元。

私营企业

1.Vizgen(包括Ultivue

累计融资:超2.5亿美元

Vizgen在《Nature Neuroscience》在线发表一项重要研究成果,重点展示了研究人员如何利用Vizgen的MERSCOPE®高通量单细胞空间多组学平台,通过单细胞和空间转录组分析白质中与衰老相关的分子变化。此外,Vizgen与Hamamatsu Photonics达成战略合作,将MoxiePlex™多重免疫荧光(mIF)成像系统与Vizgen的病理级试剂及检测产品进行整合,打造一套无缝衔接的端到端工作流程解决方案,以推动多重生物标志物检测在转化医学及临床研究新应用场景中的落地。

2.Resolve Biosciences

累计融资:超1亿美元

斯坦福大学遗传学专家Joanna Bi在Protocols.io平台发布了一项实验方案,该方案介绍了如何在肠道组织研究中应用Resolve的Molecular Cartography™平台来进行全视野光学相干断层成像(FF-OCT)分析。Bi同时是人类生物分子图谱计划(HuBMAP)方法开发社区成员,该社区致力于推动建立单细胞分辨率的人体空间图谱绘制技术框架。近期,Resolve发布了系统工程师、专注于系统集成的实验室技术员以及专注于检测开发实验室技术员的招聘信息。

3.RareCyte

累计融资:1.25亿美元

RareCyte近期推出了40重免疫表型分析Panel(40-plex Immune Profiling Panel),该产品旨在帮助研究人员使用涵盖免疫表型、功能及组织结构在内的40种核心生物标志物立即生成相关的空间结构信息。研究者可根据自身需求对该检测Panel进行定制,调整为3轮成像分析中检测标志物数量扩展至最多50种以适配不同研究场景,满足更大规模的研究需求。Orion平台在ImmGenMaps项目中发挥着关键作用。该项目由ImmGen联盟发起,旨在对整个小鼠解剖结构中所有免疫细胞进行空间分析。

4.Stellaromics

累计融资:1.05亿美元

Stellaromics于20205年2月完成8,000万美元B轮融资,该轮融资由Catalyst4领投,斯坦福大学Ventures参投。该融资旨在支持Stellaromics的3D空间生物学平台Pyxa的开发和商业化。4月,Stellaromics宣布Pyxa平台首次实现欧洲地区部署——格拉斯哥大学Nigel Jamieson医学博士实验室采用了Pyxa的完整3D 空间多组学工作流程,用于研究肿瘤组织结构及微环境。Jamieson空间实验室作为空间生物学的核心设施,其目标是发现新的癌症生物标志物,为药物研发及未来临床转化应用提供依据。

5.Nucleai

累计融资:6000万美元

Nucleai是一家基于人工智能(AI)的空间生物标志物和诊断公司,该公司于4月宣布推出其首款深度学习模型。该模型旨在自动化高通量成像数据的标准化处理——这是空间蛋白质组学工作流程中的基础步骤,可以加速抗体-药物偶联物(ADCs)、双特异性抗体及免疫疗法生物标志物的发现。在近期召开的美国临床肿瘤学会(ASCO)年会上,Nucleai展示了其基于光密度(OD)的定量生物标志物评分解决方案,旨在解决病理学家对免疫组织化学(IHC)图像进行人工视觉评分时遇到的挑战。

三、领域新星

1.华大智造

华大智造于8月与韩国JCBio公司合作启动了DCS实验室项目,旨在加速韩国的多组学创新。DCS于2023年推出,服务于国际实验室,代表了华大智造的三大核心技术——基因组学、细胞组学和空间组学。华大智造的美国子公司Complete Genomics在3月开始向人类细胞图谱项目的成员提供STOmics的空间转录组产品。同时,Complete Genomics与BioTuring合作,为研究人员提供SpatialX这一深度学习工具,进行多技术融合的空间数据分析,该工具也与STOmics相关的化学分析技术兼容。在2025年基因组生物学与技术进展(AGBT)大会上,华大智造和Complete Genomics发布了DNBSEQ-T1+下一代中通量测序仪,该设备专为满足空间基因组研究及其他基因组分析需求而设计,具备较高的测序速度与灵活性。

2.Illumina

虽然Illumina在NGS领域占据领先地位,但在空间分析领域尚在起步阶段。据悉,该公司计划于2026年解决这一短板,届时将推出在AGBT上首次亮相的空间转录组学技术。该技术兼容Illumina的NextSeq和NovaSeq测序仪,并采用新型多模态分析平台。根据介绍,该技术能够让研究人员在每次实验中检测数百万个细胞的空间位置关系,捕获区域的大小是现有技术的9倍,分辨率也提高4。在AGBT会议上,来自Broad、St. Jude儿童研究医院和TGen的科研人员分享了使用该空间技术的数据案例。

3.Kanvas Biosciences

Kanvas Biosciences在8月份表示将在美国加州南旧金山开设一个新的GMP实验室,以此提升其生产活性生物治疗产品的能力。该实验室将满足临床级生产标准,其设立目的在于帮助Kanvas公司顺利地从研发阶段和工艺开发阶段无缝过渡到GMP生产阶段,从而为其主要在研药物KAN-001的I期和II期临床试验。KAN-001是一种处于临床前研究阶段的在研药物,专门用于治疗对检查点抑制疗法具有抗性的癌症。3月31日,Kanvas研究人员在bioRxiv上发布了一份预印本文章,详细介绍了该公司研发的高系统发育分辨率空间成像技术平台(HiPR-Map),该平台旨在帮助人们准确识别并确定复杂微生物群落中各类微生物细胞的空间定位。

4.Pixelgen Technologies

2025年6月,Pixelgen Technologies获得了欧洲创新委员会(EIC)Accelerator计划提供的1250万欧元(约合1470万美元)的资助与股权融资。Accelerator计划属于欧盟“Horizon Europe”计划的一部分,旨在为那些拥有颠覆性创新技术的初创企业提供支持。Pixelgen将利用这笔融资扩大其Pixelgen Proxiome试剂盒的应用范围,该试剂盒于2025年早些时候推出,是首个用于高容量单细胞蛋白质相互作用组分析的试剂盒和配套软件。该试剂盒是基于Pixelgen的邻近网络分析技术开发,该技术能够实现免疫细胞蛋白的纳米级空间分析规模化应用。

5.Single Technologies

Single Technologies同样从EIC Accelerator获得了1250万欧元(约合1470万美元)的投资。Single表示,该资金包括250万欧元(约合290万美元)的非稀释性资助,以及来自欧洲最大的深度科技初创企业投资机构EIC基金的1000万欧元(约合1170万美元)的直接股权投资。目前,Single Technologies正在开发3D空间测序平台Theta™,以直接在3D空间以分子级精度读取组织和细胞的生物信息。该平台还旨在使全基因组测序的成本低至每个基因组10美元。

6.Syncell

2025年8月,Syncell宣布与赛默飞公司达成战略合作营销协议,旨在将一种高度集成、高分辨率空间蛋白质组学分析技术推向市场。两家公司合作的目标是Syncell的空间蛋白纯化技术Microscoop®与赛默飞的Orbitrap™Astral™和Orbitrap™Astral™Zoom质谱仪整合在一起。Syncell成立于2020年,旨在将创始人兼首席执行官廖政志在中国台湾中央研究院实验室开发的技术商业化。目前,Syncell已获得融资3000万美元。

7.Takara Bio USA(包括Curio Bioscience

2025年,Takara Bio收购了Curio Bioscience,将业务扩展到空间生物学领域。Curio Bioscience是2024年本榜单上备受关注的新兴公司之一。作为在2011年首家推出商业化单细胞RNA-seq技术的公司,Takara Bio现在提供两种空间组学技术:Seeker和Trek- ker,每一种技术都是为了将空间分析方法无缝地应用于单细胞研究而设计的。Seeker是专为那些希望以近单细胞分辨率下实现无偏倚全转录组发现,且不受限于任何专有系统的研究人员设计的。Trekker在Seeker的基础上增加了在组织环境中标记并追踪单个细胞核的功能。将其集成到现有的单细胞多组学工作流程中,为单细胞数据集添加了空间定位信息。Takara Bio USA已经确定了其空间组学产品的三个应用领域:癌症生物学与肿瘤微环境、发育生物学、神经科学。

在全球医疗健康行业快速发展的背景下,空间组学的发展备受市场关注。随着在临床应用转化与肿瘤市场应用愈加广泛,空间组学技术的检测精度在不断提升、多组学整合能力逐步增强,相关产品的研发与产业化也迎来爆发式发展。

2025年,中国各空间组学企业也取得了显著的发展。德运康瑞全球首发DynaStation空间组学前处理系统,“一步上机”的颠覆性设计将探针杂交、清洗、复染等10项繁琐流程全面自动化;赛陆医疗完成数千万元B1轮融资,其超高密度空间转录组芯片可实现高分辨率和高捕获效率;真迈生物发布创新产品SURFSpace空间组学芯片,该芯片基于SURFSeq测序技术打造,拥有1.5μm的分辨率,且支持用户自定义探针;联川生物创新性开发在同一张切片、同一层细胞中进行Xenium空间原位转录组学和PCF空间原位蛋白质组学的空间原位蛋白基因组学方案,实现了同一张切片、原位空间多组学、亚细胞级别分辨率的数据无缝整合;百迈客生物自主研发的百创S系列空间组学系列产品持续推动我国空间组学研究从基础科研向临床转化迈进;非因生物以多种空间组学技术和靶向蛋白组学技术为核心,在癌症的基础研究、转化医学、临床研究、药物开发、临床诊疗等各领域开展自主及合作研究,并提供全方位高水准的科研及临床解决方案······还有很多家国内公司在空间组学领域不断布局和创新,在此不一一列举。目前,整个空间组学领域发展呈现出技术多元化和应用扩展的趋势,涵盖从硬件设备到数据分析工具的全方位创新,为未来的市场发展带来无限可能。

参考资料:

Top 10 Spatial Biology Companies of 2025

Spatial Companies: Up & Comers 2025

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