单个cfDNA样本产生2亿个reads!新纳米孔测序方法揭示癌症cfDNA单分子甲基化谱 | Genome Med 陈初夏 科研 2023-05-29 该文章介绍了一种纳米孔单分子测序方法,用于有效地表征癌症患者cfDNA的甲基化谱。
单个cfDNA样本产生2亿个reads!新纳米孔测序方法揭示癌症cfDNA单分子甲基化谱 | Genome Med 陈初夏 科研 2023-05-29 该文章介绍了一种纳米孔单分子测序方法,用于有效地表征癌症患者cfDNA的甲基化谱。
PNAS | 卢煜明/江培勇团队基于末端基序反卷积分析绘制cfDNA片段化图谱 白云 科研 2023-05-12 研究团队开发了一种识别不同类型cfDNA片段模式的方法F-profile,可确定样本中不同cfDNA片段化模式的比例。
PNAS | 卢煜明/江培勇团队基于末端基序反卷积分析绘制cfDNA片段化图谱 白云 科研 2023-05-12 研究团队开发了一种识别不同类型cfDNA片段模式的方法F-profile,可确定样本中不同cfDNA片段化模式的比例。
无需匹配血液或肿瘤组织,仅cfDNA测序即可检测克隆性造血,并区分突变来源 | Sci Transl Med 白云 科研 2023-04-07 该研究提出了一种准确的机器学习方法,能够从cfDNA样本中发现CHIP变异,减少了临床环境中对WBC测序的需求。
无需匹配血液或肿瘤组织,仅cfDNA测序即可检测克隆性造血,并区分突变来源 | Sci Transl Med 白云 科研 2023-04-07 该研究提出了一种准确的机器学习方法,能够从cfDNA样本中发现CHIP变异,减少了临床环境中对WBC测序的需求。
Nat Commun | 深圳湾实验室孙坤课题组揭示游离DNA片段化模式的调控机理及其应用 白云 科研 2023-02-08 该研究揭示了DNA甲基化是外周血中循环血浆游离DNA(cell-free DNA,cfDNA)的重要调控元件,并基于此原理开发了全新的泛癌种、跨平台癌症诊断标志物,深入探索了cfDNA片段化模式的分子机理以及临床转化价值。
Nat Commun | 深圳湾实验室孙坤课题组揭示游离DNA片段化模式的调控机理及其应用 白云 科研 2023-02-08 该研究揭示了DNA甲基化是外周血中循环血浆游离DNA(cell-free DNA,cfDNA)的重要调控元件,并基于此原理开发了全新的泛癌种、跨平台癌症诊断标志物,深入探索了cfDNA片段化模式的分子机理以及临床转化价值。
Clinical Chemistry发表新型产前唐氏综合征cfDNA筛查方法,检出率可达95.9% 白云 科研 2022-10-20 该研究评估了基于RCA的cfDNA方法的筛查性能,包括在21-三体性的检出率,假阳性和测试失败率。结果显示,RCA和其他5个简化系统的早期评估结果令人鼓舞。
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Nat Commun | 低覆盖度全基因组cfDNA测序分析方法Pointy,可准确识别癌症患者血浆中的突变特征 白云 科研 2022-09-13 低覆盖率血浆WGS的检测方法为cfDNA中的突变特征及其在肿瘤学中的潜在用途提供了一个深入的见解。
Nat Commun | 低覆盖度全基因组cfDNA测序分析方法Pointy,可准确识别癌症患者血浆中的突变特征 白云 科研 2022-09-13 低覆盖率血浆WGS的检测方法为cfDNA中的突变特征及其在肿瘤学中的潜在用途提供了一个深入的见解。
Science Advances | 研究证实cfDNA中含有肿瘤特异性TF结合信息,可利用血浆绘制肿瘤调控图谱 白云 科研 2022-09-13 研究团队绘制了cfDNA中乳腺癌高分辨率的ER和FOXA1肿瘤TF结合图谱,发现血浆中TF印记的富集反映了TF在起源组织中的结合强度。
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和瑞基因推出多癌种早筛产品“全思宁”,一次性可实现六大高危癌症早筛 白云 资讯 2022-06-29 “全思宁”是目前全球首个采用游离DNA(cfDNA)多维度全基因组测序(WGS)技术的多癌种早筛产品。cfDNA多维度WGS技术相较其他技术能够在更广泛的范围内捕捉癌症早期信号,降低因个体化及不同肿瘤分子生物学特征差异导致的漏检。
和瑞基因推出多癌种早筛产品“全思宁”,一次性可实现六大高危癌症早筛 白云 资讯 2022-06-29 “全思宁”是目前全球首个采用游离DNA(cfDNA)多维度全基因组测序(WGS)技术的多癌种早筛产品。cfDNA多维度WGS技术相较其他技术能够在更广泛的范围内捕捉癌症早期信号,降低因个体化及不同肿瘤分子生物学特征差异导致的漏检。
清华大学汪小我团队发表通过cfDNA甲基化测序数据预测早期肿瘤的人工智能算法DISMIR | Brief Bioinform 白云 其它 2021-07-14 DISMIR基于DNA序列和甲基化的关联模式与细胞状态间隐含的机制联系,将测序样本中的每一条读段作为输入,利用海量测序数据提取DNA序列和甲基化之间的关联模式,推断读段的来源,成功发挥了深度学习方法在复杂模式提取学习方面的强大优势。
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