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Nat Commun | 利用cfDNA片段组监测癌症治疗的新方法DELFI-TF,无需肿瘤先验遗传信息即可确定肿瘤负荷!

Nat Commun | 利用cfDNA片段组监测癌症治疗的新方法DELFI-TF,无需肿瘤先验遗传信息即可确定肿瘤负荷!

戴胜戴胜 科研 2024-11-08
DELFI-TF在监测治疗方面比传统临床方法更敏感。
Genome Med | 首次揭示DNA去甲基化可促进结直肠癌细胞释放cfDNA,或可提高液体活检的灵敏度

Genome Med | 首次揭示DNA去甲基化可促进结直肠癌细胞释放cfDNA,或可提高液体活检的灵敏度

陈初夏陈初夏 科研 2024-10-28
该研究首次在CRC临床前模型的大型数据集中剖析了cfDNA的释放情况,发现癌细胞DNA甲基化状态与cfDNA释放相关,DNA去甲基化可促进cfDNA释放,且与染色质可及性和碎片化增加有关。
Nat Genet | 单分子测序绘制cfDNA全基因组突变谱,可用于癌症早期检测和治疗监测

Nat Genet | 单分子测序绘制cfDNA全基因组突变谱,可用于癌症早期检测和治疗监测

白云白云 科研 2023-08-15
研究团队开发了一种利用单分子测序识别cfDNA中大量体细胞突变的方法GEMINI。
单个cfDNA样本产生2亿个reads!新纳米孔测序方法揭示癌症cfDNA单分子甲基化谱 | Genome Med

单个cfDNA样本产生2亿个reads!新纳米孔测序方法揭示癌症cfDNA单分子甲基化谱 | Genome Med

陈初夏陈初夏 科研 2023-05-29
该文章介绍了一种纳米孔单分子测序方法,用于有效地表征癌症患者cfDNA的甲基化谱。
PNAS | 卢煜明/江培勇团队基于末端基序反卷积分析绘制cfDNA片段化图谱

PNAS | 卢煜明/江培勇团队基于末端基序反卷积分析绘制cfDNA片段化图谱

白云白云 科研 2023-05-12
研究团队开发了一种识别不同类型cfDNA片段模式的方法F-profile,可确定样本中不同cfDNA片段化模式的比例。
无需匹配血液或肿瘤组织,仅cfDNA测序即可检测克隆性造血,并区分突变来源 | Sci Transl Med

无需匹配血液或肿瘤组织,仅cfDNA测序即可检测克隆性造血,并区分突变来源 | Sci Transl Med

白云白云 科研 2023-04-07
该研究提出了一种准确的机器学习方法,能够从cfDNA样本中发现CHIP变异,减少了临床环境中对WBC测序的需求。
Nat Commun | 深圳湾实验室孙坤课题组揭示游离DNA片段化模式的调控机理及其应用

Nat Commun | 深圳湾实验室孙坤课题组揭示游离DNA片段化模式的调控机理及其应用

白云白云 科研 2023-02-08
该研究揭示了DNA甲基化是外周血中循环血浆游离DNA(cell-free DNA,cfDNA)的重要调控元件,并基于此原理开发了全新的泛癌种、跨平台癌症诊断标志物,深入探索了cfDNA片段化模式的分子机理以及临床转化价值。
Clinical Chemistry发表新型产前唐氏综合征cfDNA筛查方法,检出率可达95.9%

Clinical Chemistry发表新型产前唐氏综合征cfDNA筛查方法,检出率可达95.9%

白云白云 科研 2022-10-20
该研究评估了基于RCA的cfDNA方法的筛查性能,包括在21-三体性的检出率,假阳性和测试失败率。结果显示,RCA和其他5个简化系统的早期评估结果令人鼓舞。
Nat Commun | 低覆盖度全基因组cfDNA测序分析方法Pointy,可准确识别癌症患者血浆中的突变特征

Nat Commun | 低覆盖度全基因组cfDNA测序分析方法Pointy,可准确识别癌症患者血浆中的突变特征

白云白云 科研 2022-09-13
低覆盖率血浆WGS的检测方法为cfDNA中的突变特征及其在肿瘤学中的潜在用途提供了一个深入的见解。
Science Advances | 研究证实cfDNA中含有肿瘤特异性TF结合信息,可利用血浆绘制肿瘤调控图谱

Science Advances | 研究证实cfDNA中含有肿瘤特异性TF结合信息,可利用血浆绘制肿瘤调控图谱

白云白云 科研 2022-09-13
研究团队绘制了cfDNA中乳腺癌高分辨率的ER和FOXA1肿瘤TF结合图谱,发现血浆中TF印记的富集反映了TF在起源组织中的结合强度。

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