宏基因组测序技术助力腹泻暴发调查中病原体识别 白云 科研 2021-08-09 宏基因组测序在探索腹泻样本中的病原体时,是一种全面系统、无偏、更灵敏的方法,可为未来快速诊断腹泻暴发中的病原体、乃至进一步精准防控提供技术基础和依据。
加州大学钟声教授团队开发高通量蛋白互作检测技术,快速绘制人类蛋白互作图谱 | Molecular Cell 白云 科研 2021-08-09 利用PROPER-seq方法,研究团队构建了人类 PPI参考图谱,包括210518个PPI,涉及8635种蛋白质,证明该方法是一种可在转录组水平绘制PPI图谱的高效技术。
Science | 空间转录组学新方法—sci-Space,实现单细胞分辨率绘制基因表达图谱 白云 科研 2021-08-09 研究团队利用获得的空间分辨单细胞数据,开发了一种统计方法来识别发育中胚胎空间调控基因表达的细胞类型,并发现了新的神经元迁移模式。
UK Biobank全外显子精细定位分析,揭示新的性状相关罕见编码变异 白云 科研 2021-08-09 研究团队通过依赖UKB队列中的单倍型共享,将外显子组范围的变异输入到整个队列中,共分析了54个数量性状,最终确定了1189个显著的性状变异关联,包括影响身高的罕见变异。
Cell Reports | 基于大规模转录组数据,系统比较四种降维算法分析样本异质性 白云 科研 2021-08-09 研究团队建议在分析较大样本量的转录组测序数据集时采用UMAP降维算法,加强样本聚类异质性研究和基因表达差异分析。
复旦大学中山医院樊嘉院士、杨欣荣教授团队合作揭示肝细胞癌CTC空间异质性和免疫逃避机制 白云 其它 2021-08-09 该研究揭示了原发性肝癌的空间异质性和免疫逃逸机制,有助于设计新的抗转移治疗策略。
新技术!蛋白-DNA交互作用在单分子水平迎来重要突破! 白云 科研 2021-07-27 该文章介绍了一种基于构建葡萄球菌蛋白A-甲基转移酶融合重组蛋白,对抗体结合的组蛋白修饰、DNA结合蛋白附近的DNA进行特异性定点甲基化修饰,并通过长读长测序,获得高精度的、DNA单分子水平上的组蛋白修饰及DNA结合蛋白序列信息。
AJHG背靠背发文:光学基因组图谱进行染色体畸变检测,或将开启“下一代细胞遗传学”时代 白云 其它 2021-07-27 该方案可以用于全面检测染色体畸变和染色体结构变异,和现有标准分析手段检测结果具有非常高的一致性,或将开启“下一代细胞遗传学”时代。
NAR|北大/中科院计算所团队发布基因功能富集分析平台KOBAS-i 白云 科研 2021-07-27 北京大学孔雷课题组与中国科学院计算技术研究所赵屹研究员课题组合作开发的基因功能富集平台KOBAS-i