Clin Cancer Res | 基于NGS的CaptHPV液体活检方法,可用于不同类型HPV相关肿瘤检测 白云 科研 2021-12-31 研究团队提出了基于NGS的CaptHPV方法,该方法用于捕获和广泛表征从肿瘤组织提取的DNA中识别的所有HPV DNA序列。此外,研究团队还发现在与任何HPV基因型相关的癌症患者中,都可以通过分析标准血液样本获得完整的病毒基因组特征…
Nat. Biotechnol综述 | 纳米孔测序技术、生物信息学及应用 白云 科研 2021-12-31 综上所述,纳米孔测序通过实时提供单个DNA/RNA分子的超长reads,使许多生物医学研究成为可能。同时,ONT测序技术仍存在一些局限性,包括错误率较高,对核酸材料的需求量较高。克服这些挑战需要在纳米孔技术、分子实验和生物信息学软件…
NSCLC免疫治疗面面观 | 对话周承志教授、谢展鸿教授:免疫标志物在肺癌精准诊疗中的应用和展望 白云 人物 2021-12-31 测序中国特邀广州医科大学附属第一医院呼吸与危重症医学科的周承志教授和谢展鸿教授进行专访。采访中,周承志教授和谢展鸿教授分享了NSCLC免疫标志物PD-L1、TMB等在肺癌精准诊疗中的应用和展望,同时就NSCLC免疫治疗及不良反应处理…
Blood Cancer Discovery | NGS-MRD可预测急性淋巴细胞白血病免疫治疗后复发风险 白云 科研 2021-12-31 该研究表明,ALL患者接受Tisagenlecleucel治疗一年内,可用于预测复发风险的最敏感及最具可操作性的生物标志物是持续性B细胞发育不全和NGS-MRD。如果患者在6个月内B细胞发育不全丧失,或BM NGS-MRD检测值>0…
Nat. Biotechnol | 基于多维数据的深度融合,大幅提升空间转录组分辨率 白云 科研 2021-12-31 该研究证明了组织学图像数据对组织中的空间表达模式具有高度的信息量,并提出了将ISC、高分辨率图像数据相融合的空间基因表达综合模型,可推断超分辨率表达图,能够用于研究详细解剖特征中的基因表达。
新版发布 | 单细胞大数据挖掘神器OmniBrowser™推出全新版本v3.1 白云 资讯 2021-12-22 百奥智汇推出全新版本单细胞大数据平台OmniBrowser™ v3.1。v3.1版本是该平台自2021年年初发布v3.0之后的重大更新,在用户界面、分析功能、数据检索等方面都有进一步的优化和提升,大大降低单细胞数据分析与挖掘的门槛,…
Nature Genetics发表迄今最大规模血浆蛋白质组研究,揭示冰岛人群序列变异与蛋白质水平之间的关联 白云 科研 2021-12-22 综上所述,该研究针对血浆蛋白水平进行GWAS分析,发现了18,084个序列变异和血浆中蛋白质水平之间的关联,并确定了257,490种相关性。研究团队整合了pQTL与疾病和其他性状的遗传关联,发现GWAS目录中45,334个先导关联中…
Cell | 加州大学任兵团队发表迄今最大规模人类单细胞染色质可及性图谱 白云 科研 2021-12-22 该研究利用单细胞ATAC-seq分析了代表广泛人类器官系统30个成人组织的约60万个细胞的染色质可及性,并通过与已有的数据进行集成分析,绘制了迄今最大规模的人类单细胞染色质可及性图谱,填补了人类基因组CCRE注释中细胞类型分辨率的关…
Nat Methods | 李明瑶团队发表空间转录组数据分析的新算法SpaGCN,可检测出具有空间表达模式的SVG 白云 其它 2021-12-22 研究团队推出了一种结合基因表达、空间定位和组织学的方法——SpaGCN,能够来模拟基因表达的空间依赖性,并用于识别空间区域和鉴定空间富集SVG。性能验证实验的结果一致表明,SpaGCN可以识别具有一致基因表达和组织学的空间域,并且检…
燃石医学发布OncoMaster™肿瘤基因组数据大师,赋能肿瘤NGS智能实验室2.0时代 白云 科研 2021-12-22 2021年12月17日,燃石医学(NASDAQ:BNR)正式发布NGS自动化数据分析及报告解读产品——OncoMaster™肿瘤基因组数据大师,包括两款搭载服务器与一体机的OncoMaster™ Pro、OncoMaster™以及O…