Nature 子刊 | 汕头大学医学院等团队基于单细胞转录组测序，揭示食管鳞状细胞癌肿瘤微环境异质性 白云 科研 2022-01-10 利用高通量scRNA-seq揭示肿瘤异质性，破译癌症发展过程中癌细胞与其微环境组分之间的相互作用，是进一步了解癌症和制定有效的早期诊断和治疗策略的基础。该研究基于单细胞转录组数据探究了ESCC肿瘤微环境的异质性，鉴定了有预后价值和潜…
表观遗传学研究利器——ATAC-seq技术，高效探索染色质开放区 白云 其它 2022-01-10 ATAC-seq是一种高效探索染色质开放区的技术，适用于机制研究，探索信号通路、表型变化、疾病等与基因调控的相关性。并以其简便高效、重复性好等优点，成为研究染色质开放区的有效技术方法。
Nature子刊 | Dana-Farber癌症研究所开发基于大型癌症基因组数据集的NLP模型，适用多种癌症类型 白云 科研 2022-01-10 该研究应用深度NLP人工智能神经网络方法来提取临床信息，包括癌症反应、进展和转移位点，并关联到实体肿瘤患者的基因组数据。虽然该模型是通过对整个队列中大约21%的患者信息进行了基于标签的手动审查来训练和验证，但模型仍能够推广到那些临床…
Science发布基因组比对革新技术：泛基因组学映射工具Giraffe 白云 科研 2022-01-10 Giraffe算法通过使用短读长测序数据可以准确地对SNV、InDels和SV进行基因分型，其速度可与映射到单一参考基因组的标准方法相媲美。
Science Advances | 王红阳/陈磊/古槿团队联合绘制原发性肝癌高分辨率空间转录组图谱 白云 科研 2022-01-10 该研究构建了首个基于原发性肝癌三个主要亚型的高分辨率空间转录组图谱，并确定了TME特征，包括基质和免疫细胞分布、肿瘤细胞簇相互作用、癌症干细胞生态位多样性和三级淋巴结构（TLS）组成。这是第一个分析全基因组TME特征的研究，从正常组…
多物种，跨组学丨伯科高品质DNA合成技术实现多平台靶向测序应用的领先水平 白云 其它 2021-12-31 伯科已经建立了完整的国产化液相基因芯片合成产品线。在无锡市政府部门的帮助和支持下，伯科已经在锡东建成了国内最大的液相基因芯片生产基地和应用示范中心并投入使用。
最新获批，填补市场空白！国产基因测序仪成为国内首批获准RNA预期用途的产品 白云 产业 2021-12-31 国家药品监督管理局正式发布“医疗器械批准证明文件（变更）待领取信息”。经查询得知，在这次获得变更批准的71项医疗器械中，来自华大智造的基因测序仪位列其中。此前，MGISEQ-200和MGISEQ-2000已于12月15日和12月20…
登顶Cell！北京林业大学联合安诺优达完成染色体水平的油松基因组组装和甲基化研究 白云 科研 2021-12-31 在该研究中，研究者构建了当前大型基因组中连续性最好的高质量染色体水平的油松基因组。该研究发现转座子的不断扩张和缓慢清除是导致针叶树基因组巨大的重要原因，具有超长内含子的大基因往往表达水平较高。与被子植物相比，油松具有独特的生殖系统。…
每个基因组低至10美元！Genome Biology发表快速高效的新型大规模细菌基因组测序方法 白云 科研 2021-12-31 该研究提供了一个低成本、稳定的工具，用于生成细菌基因组数据，分析细菌分离株的流行病学、耐药性和毒力因子，可促进细菌病原体的快速和大规模基因组测序，助力流行病的研究。
