Cancer Cell | 基于上千例泛癌多组学数据,CPTAC发布蛋白基因组学共享数据资源 概述了CPTAC泛癌研究团队在数据协调、数据传播和帮助生物发现的计算资源方面所做出的努力,并讨论了多组学数据整合和分析的挑战。
核酸捕获成本降低2-3个数量级!林兰/邢毅团队发表一种通用、低成本的靶向长读长RNA测序技术 TEQUILA-seq可将目标捕获的单样本成本降低2-3个数量级,可广泛用于各种生物、医学、临床环境中全长转录本的靶向测序。
浅谈晚期肺癌诊疗及基因检测意义 白云 科研, 肿瘤诊疗&基因检测 2023-11-16 原发性支气管肺癌简称肺癌,是我国及世界各国发病率和死亡率较高的恶性肿瘤之一。但大多数早期肺癌无明显症状,临床上多数患者出现症状就诊时已属晚期。虽然手术方式的不断革新,为可手术的早中期患者带来极大生存获益。但肺癌患者的总体生存期仍然差…
Nature | 快速纳米孔测序+机器学习,手术期间实现中枢神经系统肿瘤的准确分类 白云 科研 2023-11-03 该研究展示了术中甲基化纳米孔测序用于儿童和成人CNS肿瘤分类的实际可行性,并可用于改善手术决策。研究团队从现成的甲基化阵列数据中生成的模拟纳米孔测序数据上进行训练,开发了深度学习方法Sturgeon。Sturgeon与快速纳米孔测序…
Genome Med | 郑骏年/董东/支巧明团队利用长读长测序全面解析CRC中的异常选择性剪接 白云 科研 2023-11-03 该研究是迄今为止对CRC中全长转录本和剪接异构体多样性最全面的表征,发现了大量未被注释的新转录本。
Genome Biology | SPIRAL:整合与对齐空间转录组数据的新工具 白云 科研 2023-11-03 该研究提出了整合多样本空间转录组的方法SPIRAL,可以有效实现对多样本、多实验流程、多实验技术的样本的批次效应去除和空间坐标对齐。随着空间转录组技术的不断发展以及大规模数据集的不断产生,SPIRAL有望成为空间转录组数据整合的有力…
Genome Medicine | 基于人血浆蛋白质组与基因组数据,鉴定新型CRC蛋白质标志物及药物靶点 白云 科研 2023-11-03 研究团队进行了一项蛋白质组范围的孟德尔随机化(MR)研究,共发现了13种蛋白质标志物与CRC易感性相关,其中2种蛋白质呈正相关、11种蛋白质呈负相关。
迈出里程碑式的一步!Nature发表最新血浆蛋白质组学图谱,揭示血浆蛋白质组、遗传学和疾病之间的关联 白云 科研 2023-11-03 这项大规模蛋白质组研究构建了一个最新的血浆蛋白质组遗传图谱,揭示了对流行疾病的生物学见解,标志着人类健康研究迈出了里程碑式的一步。
The Lancet | GRAIL发表PATHFINDER研究最终成果,证实基于血液的多癌早期检测(MCED)筛查癌症的可行性 白云 科研 2023-11-03 该最新研究确定了MCED检测在临床实践中的可行性,并描述了在收到阳性检测提示可能的癌症诊断后所进行的诊断评估。
Nat Commun丨汪小我团队提出知识引导与数据驱动相融合的合成启动子AI设计方法 白云 科研 2023-11-03 该研究基于知识引导与数据驱动相融合的创新策略,建立了人工智能辅助的启动子序列优化方法DeepSEED,能够有效突破功能启动子设计中维度高、样本小的核心难题,
因美纳推出先进的液体活检检测产品,助力实体瘤的全景变异分析 白云 资讯 2023-11-03 全新的 TruSight™ Oncology 500 ctDNA v2 (TSO 500 ctDNA v2) 是一项科研检测产品,可在组织检测不可行,或需要补充基于组织的测试时,对血液中的循环肿瘤 DNA (ctDNA) 进行无创全…