Science | 基于640万个新冠病毒基因组构建机器学习模型，可识别与适应性相关的突变 PyR0是一种贝叶斯分层回归模型，可推断一定地理区域内所有病毒谱系的相对流行率、检测谱系流行率的增加，并识别与适应性相关的突变。
Nat. Commun | 侯英勇/丁琛/贺福初团队合作发布中国人群鳞状细胞癌蛋白质组学图谱，揭示鳞状细胞癌和腺癌的分子差异 白云 资讯 2022-08-09 研究团队通过深度蛋白质组分析揭示了中国人群SCCs的共同特和异性特征，进而对SCCs的临床、生物学和治疗有更深入的了解。
Genome Biology | 纳米孔测序可用于检测cfDNA的细胞起源和癌症特异性甲基化特征 白云 科研 2022-08-09 基于cfNano和Illumina的WGS和WGBS方法在检测DNA甲基化、片段化和CNA的癌症特异性特征方面性能基本一致。
Nature发布15万人全基因组测序研究成果，揭示多个罕见变异的性状关联 白云 科研 2022-08-09 研究团队利用popSTR54在150119个WGS个体的2536688个微卫星位点上鉴定出14321,152个等位基因，这些个体平均携带810,606个非参考微卫星等位基因。
Cancer Res泛癌分析重磅揭示：通常在睾丸中表达的FOXR2基因，至少在70%癌症类型中被异常激活！ 白云 科研 2022-08-09 该研究全面绘制了不同癌症的FOXR2表达图谱，发现在成人和儿童癌症的所有癌症谱系中，至少有70%存在异常激活。
Nature Methods | 自由探索4D核组数据——马坚团队发布Nucleome Browser平台 白云 科研 2022-08-09 Nucleome Browser可为用户充分利用不同类型的4D核组数据和不同的3D表观基因组学数据集在广泛的生物环境中融合多尺度核结构和功能提供重要门户，从而实现模型整合和广泛的数据共享社区。
Cancer Cell | 基于949种人类癌细胞系绘制泛癌蛋白质组图谱，揭示数千种癌症易感性蛋白质生物标志物 白云 科研 2022-08-09 ProCan-DepMap Sanger是一个大型泛癌蛋白质组图谱，提供了超越现有分子数据集的多种见解。该图谱量化了949种人类癌细胞系中的8498种蛋白质，代表28种组织和40多种组织学上不同的癌症类型和广泛的基因型，显著扩展了癌…
Nature Genetics | DeepLoop：利用低深度Hi-C数据绘制人类基因组等位基因特异性染色质互作图谱 白云 科研 2022-08-01 研究团队开发了DeepLoop，执行严格的偏差校正，通过基于深度学习的信号增强，从低深度Hi-C数据中实现稳健的染色质相互作用映射。DeepLoop可以实现环路分辨率、单细胞Hi-C分析，还能实现不同Hi-C协议和micro-C之间…
Nature Cancer观点 | 肿瘤突变负荷与免疫治疗的现状 白云 思考, 科研 2022-08-01 近年来，肿瘤突变负荷（TMB）在免疫检查点抑制剂反应的生物标志物研究中受到了极大关注。2020年6月，美国FDA批准抗PD-1治疗药物帕博利珠单抗（Keytruda）的第二项“不限癌种”适应症，用于治疗组织肿瘤高突变负荷（TMB-H…
Nat Commun | 性能优于传统生物标志物！基于网络生物学的机器学习方法可准确预测癌症患者免疫治疗反应 白云 资讯 2022-08-01 基于NetBio的ML表现出一致的优良预测性能，并且优于纯数据驱动方法识别的特征。
J CLIN MICROBIOL | 新型低成本、高通量基因分型工具可快速识别新冠病毒变异毒株 白云 科研 2022-08-01 研究团队还开发了一种包含四种高度特异性SNP突变的基因分型工具，用于识别新冠毒株Omicron和Dela，该毒株SNP基因分型工具以及相关的统计数据均可在公开数据库中获得（ https://tracker.rosalind.bio/…
