Nat Commun | 基于32基因特征构建的机器学习模型可有效预测胃癌患者的预后和治疗反应 陈初夏 科研 2022-03-01 研究团队利用NTriPath生成了一个基于32个基因谱的胃癌分型模型。
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Nature Genetics | 打破传统观点!癌症基因组中的双等位突变揭示关键驱动突变机制 白云 科研 2022-02-21 研究结果显示,双等位突变揭示了E26转化特异性(ETS)和活化T细胞核因子(NFAT)结合位点的紫外线损伤热点,以及POLE突变体和其他癌症中的超可变基序。
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Nat Commun |完全开源!肿瘤基因组数据报告解读平台,可满足商业报告解决方案 白云 科研 2022-02-21 基因组技术和生物信息学研究的快速发展为肿瘤的精准治疗提供了重要研究手段,同时也带来了重大挑战。因此必须开发简单有效的平台和分析流程,使其能够轻松地整合各种数据资源。该研究报道的PORI通过模块化报告解决了这一问题,在模块化报告中,可…
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开启空间组学新维度!樊荣团队发表Spatial-CUT&Tag技术,实现细胞水平的空间分辨染色质修饰分析 白云 科研 2022-02-21 该研究通过结合原位CUT&Tag化学、微流控DNA条形码和NGS技术,开发了Spatial-CUT&Tag技术用于空间解析组蛋白修饰的全基因组图谱。研究团队利用Spatial-CUT&Tag解析了小鼠胚胎中染色质修饰状态,揭示了空间…
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Nature | Stephen Quake团队证实:血液cfRNA检测可在妊娠早期预测子痫前期风险 白云 科研 2022-02-21 该研究证明cfRNA检测可以在孕早期预测子痫前期,在子痫前期出现数月前预测、管理哪些孕妇有特定器官损伤的风险,帮助实时表征子痫前期的发病机制。
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为何新冠患者会嗅觉或味觉失灵?Nature子刊首次揭秘这一典型症状背后的遗传因素 白云 科研 2022-02-21 该研究首次证明了个体的基因也可能发挥作用影响新冠患者感觉器官功能,并为与COVID-19相关的嗅觉或味觉丧失的生物学机制提供了遗传联系。
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Nat Commun | 国内多家单位联合发布基于纳米材料辅助的泛癌早筛新技术——MNALCI,仅需少量血清即可完成诊断 白云 科研 2022-02-21 MNALCI这一独特的方法针对不同类型的癌症,建立了一个仅需微量血清,成本更低、周期更短、通量更高的检测方式,同时具备高灵敏度和高特异性的优势,为癌症的临床诊断提供了新的方向和可能。该MNALCI技术采用非靶向半定量质谱衍生的生化特…
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Nat Mach Intell | 江瑞课题组提出首个针对单细胞染色质开放性数据的细胞类型辨识神经网络模型EpiAnno 白云 科研 2022-02-21 EpiAnno是首个针对单细胞染色质开放性数据的细胞类型自动辨识算法,在准确进行细胞类型注释的同时,提供了全面的模型解释性,并成功应用于基础生物学和医学遗传学研究中。
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Cell | 人类肝脏单细胞空间多组学图谱揭示独特且进化保守的肝巨噬细胞生态位 白云 科研 2022-02-10 研究团队绘制人类和小鼠的肝脏单细胞空间蛋白质基因组图谱,揭示了稳态Kupffer细胞的保守和独特的转录组;通过揭示肝细胞的空间定位,确定了健康小鼠、人类和猕猴肝脏胆管周围的 LAM。当脂肪变性时,LAMs 优先被富集到肝脏的脂肪变性…
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