Mol Cell | 北京基因组所杨运桂团队及合作者揭示表观转录组学与癌症的“意外”关联 白云 科研 2024-01-05 这一发现不仅为理解白血病的病因打开了一扇新的大门,而且它可能导致新的治疗策略和基于RNA表观遗传学的研究。
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华大基因开发新型空间染色质可及性测序工具SCA-seq,以单分子分辨率捕获表观遗传信息同时解析基因组构象 白云 科研 2024-01-05 该研究团队报道了新开发的SCA-seq,将传统染色质可及性的概念扩展到高维空间,以单分子分辨率同时分析DNA甲基化、染色质可及性、转录因子结合和染色质构象。
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Nature | gnomAD数据库研究新成果:基于7.6万人WGS数据构建全基因组突变约束图谱 白云 科研 2023-12-22 人类全基因组约束图谱的开发是基因组研究领域的一个重要突破,该研究证明了Gnocchi在表征非编码区和蛋白质编码基因方面的价值,并强调了将基因组学的最新成果应用于疾病研究和治疗的重要性,
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NAR|深圳国家基因库/华大生命科学研究院发表空间转录组学数据共享、分析和可视化综合数据库STOmicsDB 白云 科研 2023-12-22 研究介绍的STOmicsDB有助于推动空间转录组学领域的研究,为数据归档、共享、可视化和分析提供方便的途径和工具。
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Commun Biol | 复旦附属中山医院团队揭示原发性肝癌微环境分子特征及空间异质性 白云 科研 2023-12-22 研究团队展示了PLC的详细情况,同时包括HCC、ICC和CHC,并涵盖了病毒特征和肿瘤大小的多样性。
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NAR|中山大学杨建华/屈良鹄团队发表RMBase v3.0平台:解码RNA修饰图谱、机制和功能 白云 科研 2023-12-22 RMBase v3.0采用多种标准化方法和流程解码了62个物种73种RNA修饰的最全面图谱、潜在机制和功能。
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Cell Genomics | 范骁辉/ 陆晓燕团队开发新型空间映射计算工具SpaTrio,揭示组织空间多模态异质性 白云 科研 2023-12-22 研究团队开发了一种名为SpaTrio的计算方法,可以通过概率比对整合数据集来构建空间多组学数据,并进一步分析基因调控和细胞相互作用。
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Illumina AI实验室等团队识别239种灵长类动物基因组的约束调控序列元件 白云 科研 2023-12-22 研究团队通过将239种灵长类动物的基因组(包括187种新组装的灵长类动物),鉴定了数十万个约束非编码序列元件。
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英国生物样本库(UKB)向全球开放50万人全基因组测序数据 白云 科研 2023-12-22 近日,英国生物样本库(UKB)表示已经向全球经批准的研究人员开放了其50万参与者的全基因组测序(WGS)数据。这是有史以来最雄心勃勃的同类项目代表了迄今为止世界上最大的单一测序数据集。该数据集有潜力为主要常见病的病因提供新见解,并指…
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Genome Res | 西奈山伊坎医学院张斌团队发现超4700个基因簇对32种癌症的预后至关重要 白云 科研 2023-12-22 癌症是一个多面和复杂的调控过程。目前,人们开发了各种网络方法来描述基因相互作用并解剖肿瘤发生通路的调控关系。其中,基因共表达网络是一种数学模型,它假设功能相关的基因作为一个系统被共同调节,并且可以嵌入在一个共表达网络。剖析基因共表达…
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