Nat Commun | 基于短读长和长读长测序的宏基因组分析,揭示东南亚人群的微生物组多样性 白云 科研 2022-11-10 研究人员利用新的宏基因组分析方法,在685个菌株中鉴定出70个新的肠道菌,并发现了3413个种群特有的菌株。
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Nat Genet | 单细胞测序与GWAS整合分析工具:sc-linker可识别疾病关键细胞类型和细胞过程 白云 科研 2022-11-09 研究团队开发一个集成框架sc-linker,通过整合来自多种组织类型、疾病、个体和细胞的GWAS总结统计数据、表观基因组学和scRNA-seq数据,将人类疾病和复杂性状与细胞类型和细胞过程联系起来。
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Gastroenterology | 新型NGS检测方法PancreaSeq可准确区分不同类型胰腺囊肿,敏感性和特异性更高 白云 科研 2022-11-03 PancreaSeq通过对胰腺囊肿相关基因进行测序,能够准确地区分良性囊肿和可能癌变的囊肿,并且对晚期肿瘤具有高度特异性。
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Nature | 超6万人全基因组序列分析结果揭示:线粒体DNA插入人类基因组从未停止 白云 科研 2022-11-02 通过大规模的研究结合多层面的基因组数据,并根据NUMT的大小和基因组位置,研究团队绘制了一个高度异质性和动态的人类NUMT图谱。
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Nat Commun | 利用Hi-C技术绘制高分辨率人类视网膜三维基因组图谱,揭示新的AMD和青光眼相关变异位点 白云 科研 2022-11-02 研究团队通过将高分辨率Hi-C数据与表观遗传图谱和顺式调控元件整合,为人类视网膜研究提供了一个重要的数据资源,促进了基因组调控的研究。
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Clinical Chemistry发表新型产前唐氏综合征cfDNA筛查方法,检出率可达95.9% 白云 科研 2022-10-20 该研究评估了基于RCA的cfDNA方法的筛查性能,包括在21-三体性的检出率,假阳性和测试失败率。结果显示,RCA和其他5个简化系统的早期评估结果令人鼓舞。
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Nature | 为什么有些人感染新冠后死亡风险高?研究揭示与APOE基因型有关 白云 科研 2022-10-20 研究表明,APOE2和APOE4小鼠的不良结果可能是由早期感染期间增强的病毒感染和适应不良免疫介导的,APOE4小鼠最终产生比APOE2小鼠更强大的抗病毒T细胞免疫。
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空间转录组学方法EEL FISH:可实现高复用、高空间通量和高分辨的原位单细胞分析 白云 科研 2022-10-14 EEL FISH基于显微镜和基于测序的空间转录组学方法建立,能够实现高复用、高空间通量和高分辨的RNA检测。
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NAR | 斯坦福大学Wing Hung Wong/清华大学江瑞课题组发布全基因功能注释HiChIP数据库 白云 科研 2022-10-14 研究团队发表了首个附带全基因组功能注释HiChIP数据库(http://health.tsinghua.edu.cn/hichipdb/)
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