Genome Biol | scRNA-seq辅助分析新方法scGWAS,揭示性状-细胞类型关联图谱 白云 科研 2022-11-18 研究团队开发了一种新方法——scGWAS,并将其应用于40个涵盖了各种复杂人类特征的GWAS数据集中。
Genome Biol | scRNA-seq辅助分析新方法scGWAS,揭示性状-细胞类型关联图谱 白云 科研 2022-11-18 研究团队开发了一种新方法——scGWAS,并将其应用于40个涵盖了各种复杂人类特征的GWAS数据集中。
Nat Commun | 肿瘤微环境获得性超增强子在结直肠癌中诱导致癌驱动基因,或可作为治疗新靶点 白云 科研 2022-11-18 该研究拓宽了对超级增强子的了解,并强调了原发性肿瘤样本和匹配对照的表观基因组分析的重要性。
Nat Commun | 肿瘤微环境获得性超增强子在结直肠癌中诱导致癌驱动基因,或可作为治疗新靶点 白云 科研 2022-11-18 该研究拓宽了对超级增强子的了解,并强调了原发性肿瘤样本和匹配对照的表观基因组分析的重要性。
PNAS | 卢煜明团队发表基于cfDNA片段模式推断甲基化模式新算法,证实cfDNA遗传和表观遗传信息可同时获得 白云 科研 2022-11-18 研究团队还开发了FRAGMA深度学习算法,处理裂解模式,可实现对单个CpG位点甲基化状态的预测。
PNAS | 卢煜明团队发表基于cfDNA片段模式推断甲基化模式新算法,证实cfDNA遗传和表观遗传信息可同时获得 白云 科研 2022-11-18 研究团队还开发了FRAGMA深度学习算法,处理裂解模式,可实现对单个CpG位点甲基化状态的预测。
Nat Commun | 基于短读长和长读长测序的宏基因组分析,揭示东南亚人群的微生物组多样性 白云 科研 2022-11-10 研究人员利用新的宏基因组分析方法,在685个菌株中鉴定出70个新的肠道菌,并发现了3413个种群特有的菌株。
Nat Commun | 基于短读长和长读长测序的宏基因组分析,揭示东南亚人群的微生物组多样性 白云 科研 2022-11-10 研究人员利用新的宏基因组分析方法,在685个菌株中鉴定出70个新的肠道菌,并发现了3413个种群特有的菌株。
Nat Genet | 单细胞测序与GWAS整合分析工具:sc-linker可识别疾病关键细胞类型和细胞过程 白云 科研 2022-11-09 研究团队开发一个集成框架sc-linker,通过整合来自多种组织类型、疾病、个体和细胞的GWAS总结统计数据、表观基因组学和scRNA-seq数据,将人类疾病和复杂性状与细胞类型和细胞过程联系起来。
Nat Genet | 单细胞测序与GWAS整合分析工具:sc-linker可识别疾病关键细胞类型和细胞过程 白云 科研 2022-11-09 研究团队开发一个集成框架sc-linker,通过整合来自多种组织类型、疾病、个体和细胞的GWAS总结统计数据、表观基因组学和scRNA-seq数据,将人类疾病和复杂性状与细胞类型和细胞过程联系起来。
Gastroenterology | 新型NGS检测方法PancreaSeq可准确区分不同类型胰腺囊肿,敏感性和特异性更高 白云 科研 2022-11-03 PancreaSeq通过对胰腺囊肿相关基因进行测序,能够准确地区分良性囊肿和可能癌变的囊肿,并且对晚期肿瘤具有高度特异性。
Gastroenterology | 新型NGS检测方法PancreaSeq可准确区分不同类型胰腺囊肿,敏感性和特异性更高 白云 科研 2022-11-03 PancreaSeq通过对胰腺囊肿相关基因进行测序,能够准确地区分良性囊肿和可能癌变的囊肿,并且对晚期肿瘤具有高度特异性。
Nature | 超6万人全基因组序列分析结果揭示:线粒体DNA插入人类基因组从未停止 白云 科研 2022-11-02 通过大规模的研究结合多层面的基因组数据,并根据NUMT的大小和基因组位置,研究团队绘制了一个高度异质性和动态的人类NUMT图谱。
Nature | 超6万人全基因组序列分析结果揭示:线粒体DNA插入人类基因组从未停止 白云 科研 2022-11-02 通过大规模的研究结合多层面的基因组数据,并根据NUMT的大小和基因组位置,研究团队绘制了一个高度异质性和动态的人类NUMT图谱。
Nat Commun | 利用Hi-C技术绘制高分辨率人类视网膜三维基因组图谱,揭示新的AMD和青光眼相关变异位点 白云 科研 2022-11-02 研究团队通过将高分辨率Hi-C数据与表观遗传图谱和顺式调控元件整合,为人类视网膜研究提供了一个重要的数据资源,促进了基因组调控的研究。
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Clinical Chemistry发表新型产前唐氏综合征cfDNA筛查方法,检出率可达95.9% 白云 科研 2022-10-20 该研究评估了基于RCA的cfDNA方法的筛查性能,包括在21-三体性的检出率,假阳性和测试失败率。结果显示,RCA和其他5个简化系统的早期评估结果令人鼓舞。
Clinical Chemistry发表新型产前唐氏综合征cfDNA筛查方法,检出率可达95.9% 白云 科研 2022-10-20 该研究评估了基于RCA的cfDNA方法的筛查性能,包括在21-三体性的检出率,假阳性和测试失败率。结果显示,RCA和其他5个简化系统的早期评估结果令人鼓舞。