发现3种罕见病的未知遗传病因!Nat Med发表轻量级、灵活的罕见病队列数据库Rareservoir 白云 科研 2023-04-18 Rareservoir提供了一个轻量级、灵活的系统,用于研究大型罕见疾病队列所需的遗传和表型数据。
发现3种罕见病的未知遗传病因!Nat Med发表轻量级、灵活的罕见病队列数据库Rareservoir 白云 科研 2023-04-18 Rareservoir提供了一个轻量级、灵活的系统,用于研究大型罕见疾病队列所需的遗传和表型数据。
Nat Commun | 泛癌TME单细胞注释新工具——scATOMIC,可准确预测转移性肿瘤的原发组织 白云 科研 2023-04-18 该研究开发了一种高度准确的单细胞注释工具scATOMIC,并使用常见的致命癌症类型的TME对其进行了基准测试和验证。
Nat Commun | 泛癌TME单细胞注释新工具——scATOMIC,可准确预测转移性肿瘤的原发组织 白云 科研 2023-04-18 该研究开发了一种高度准确的单细胞注释工具scATOMIC,并使用常见的致命癌症类型的TME对其进行了基准测试和验证。
无需匹配血液或肿瘤组织,仅cfDNA测序即可检测克隆性造血,并区分突变来源 | Sci Transl Med 白云 科研 2023-04-07 该研究提出了一种准确的机器学习方法,能够从cfDNA样本中发现CHIP变异,减少了临床环境中对WBC测序的需求。
无需匹配血液或肿瘤组织,仅cfDNA测序即可检测克隆性造血,并区分突变来源 | Sci Transl Med 白云 科研 2023-04-07 该研究提出了一种准确的机器学习方法,能够从cfDNA样本中发现CHIP变异,减少了临床环境中对WBC测序的需求。
Nat Commun | 结合HiFi、Hi-C技术优势的新算法pstools,可高效、准确重建癌症染色体单倍型基因组 白云 科研 2023-04-07 该研究将高分辨率测序技术(HiFi和Hi-C)应用于COLO829癌症系,并开发了一种快速、准确的计算方法pstools,其性能优于现有方法trio-hifiasm和salsa2,有助于精确发现SV、重建染色体水平单倍型基因组
Nat Commun | 结合HiFi、Hi-C技术优势的新算法pstools,可高效、准确重建癌症染色体单倍型基因组 白云 科研 2023-04-07 该研究将高分辨率测序技术(HiFi和Hi-C)应用于COLO829癌症系,并开发了一种快速、准确的计算方法pstools,其性能优于现有方法trio-hifiasm和salsa2,有助于精确发现SV、重建染色体水平单倍型基因组
Nat Biotechnol | 单细胞和空间转录组的高分辨率比对方法CytoSPACE,可重建复杂组织 白云 科研 2023-04-07 CytoSPACE是一个通过全局优化来分析单细胞和空间转录组的工具。
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液体活检下一个前沿!淋巴液活检,或将在癌症扩散前识别复发风险 白云 科研 2023-04-07 Droplet提出了一种用淋巴液代替血浆作为检测癌症相关DNA变化及来源的策略,该技术可以比血液更早、更灵敏地发现人体对癌症的免疫反应,在癌症扩散前识别复发风险。
液体活检下一个前沿!淋巴液活检,或将在癌症扩散前识别复发风险 白云 科研 2023-04-07 Droplet提出了一种用淋巴液代替血浆作为检测癌症相关DNA变化及来源的策略,该技术可以比血液更早、更灵敏地发现人体对癌症的免疫反应,在癌症扩散前识别复发风险。
Nat Biotechnol发表新型单碱基分辨率测序方法,可同时获取DNA的遗传和表观遗传信息 白云 科研 2023-03-23 该研究开发了一个测序平台,该平台只需要较少的DNA输入量,可在单个工作流程和数据框架中以碱基分辨率提供包括5mC和5hmC的表观遗传信息,以及全部遗传学信息。
Nat Biotechnol发表新型单碱基分辨率测序方法,可同时获取DNA的遗传和表观遗传信息 白云 科研 2023-03-23 该研究开发了一个测序平台,该平台只需要较少的DNA输入量,可在单个工作流程和数据框架中以碱基分辨率提供包括5mC和5hmC的表观遗传信息,以及全部遗传学信息。
Cell子刊 | 基于纳米孔DNA甲基化测序和Strand-seq进行亲源检测及染色体长度单倍体分型 白云 科研 2023-02-20 该方法不需要父母的序列数据或SNV联合分析,仅依靠所有人类常染色体至少有一个已知父母来源的iDMR。
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Genome Biology发表迄今最大的人类层相关染色质图谱,并鉴定一种中间染色质亚型 白云 科研 2023-02-20 该研究揭示了外周染色质组织的关键细节,特别是揭示了外周染色质在多种人类细胞类型内部和之间的一致分离,以及一组重叠但不同的层相关染色质结构域的细胞类型特异性。
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