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卫健委临检中心“全国新冠病毒核酸检测室间质评结果”,实验室合格率83.1%!

核酸检测是新型冠状病毒肺炎确诊的重要手段,从提取到完成扩增检测需要建立一个复杂且稳定的体系。由于国内有众多的核酸提取试剂以及各种不同的操作程序和实验体系,因此各实验室分析的敏感性和特异性也存在差异。为了解我国新型冠状病毒(2019⁃nCoV)核酸检测的开展现状及质量状况,国家卫生健康委临床检验中心(以下简称“临检中心”)于2020年3月16日~24 日开展了2019⁃nCoV 核酸检测室间质量评价,并将检测结果进行了统计分析。

近日,临检中心公布了2020年《全国新型冠状病毒核酸检测室间质量评价结果报告》。根据报告,本次室间质评共涵盖全国范围的包括疾控中心、公立医疗机构(综合性医院、专科医疗机构、妇幼保健机构)、独立医学实验室、海关所属国际旅行医疗保健中心、试剂研发厂家、科研院所在内的1296家实验室,共计收到844家实验室的有效结果(即回报结果完整、在截止日期内回报的结果),其中合格实验室701家(83.1%),不合格实验室143家(16.9%),实验室总体检测情况良好。

结果统计

据悉,本次质评共发放12个质评样本,各参评实验室回报结果与官方标准答案完全相符判定为合格。质评样本均为国家卫生健康委临床检验中心制备,为基因工程方法制备的噬菌体病毒样颗粒模拟样本,无生物传染危险性。该样本适用于NMPA批准的新型冠状病毒核酸检测试剂,19种未批准的商品化试剂和32家不同实验室自建方法。12个质评样本中,进行统计的样本为10个。

表:2020 年全国新型冠状病毒核酸检测室间质量评价样本信息

表:各样本总体符合率和复检率

在实验室使用试剂方法上,各实验室使用的提取方法包括手工-柱提取法、自动化仪器-柱提取法、手工-磁珠提取法、自动化仪器-磁珠提取法和裂解法。提取试剂提取试剂种类较多,包括国家药品监督管理局(NMPA)批准的新型冠状病毒检测试剂配套的核酸提取试剂以及其它核酸提取试剂。

表:各阳性样本不同试剂检测结果符合率和复检率

表:各阴性样本不同试剂检测结果符合率和复检率

在检测方法方面,各实验室使用的方法包括实时荧光RT-PCR、PCR-基因芯片、PCR-飞行时间质谱、转录介导的恒温扩增、数字PCR 和高通量测序方法(包括宏基因组测序),检测试剂包括NMPA 批准试剂以及实验室自建方法。

表. 各阳性样本不同方法检测结果符合率和复检率

表. 各阴性样本不同方法检测结果符合率和复检率

改进方向

值得关注的是,临检中心在报告中表示,本次室间质评主要评价实验室对2019-nCoV 核酸检测的能力,重点考察实验室检测的分析性能,包括分析敏感性和分析特异性,虽然实验室总体检测情况良好,但同时也反映出一些问题。

在假阴性结果方面,导致检测假阴性的原因涉及核酸提取和检测两个过程。尽管实验室一般会很关注检测试剂的性能,但实际上核酸提取试剂的质量也是检测成功的关键环节之一。在本次室间质评中,各检测试剂均存在与多个核酸提取试剂搭配使用的情况。即使采用同一核酸检测试剂,但由于核酸提取试剂的不同,检测的分析敏感性也必然会存在差异。此外,相同核酸提取纯化试剂,各实验室的检测程序也有所不同。

与此同时,核酸检测中各实验室人员提取的操作能力存在差异,个别实验室所有阳性样本均未检出。部分实验室尽管检出阳性样本,但是从报告的Ct值来看,实际上也存在较大差异。此外,一些实验室在检测过程中缺乏质量控制,一些实验室对单靶标阳性样本解读的能力不足。此外,97.5%(908/931)的回报结果使用实时荧光 PCR 法,各试剂的分析敏感性存在差异,不同靶区域的敏感性也存在差异。目前各试剂有单靶标、双靶标和三靶标检测的方式。临检中心强调,在疫情初期临床病例数不足,方法设计尚无法进行充分的验证。但是在现阶段,试剂厂家应该已有一定数量的临床数据,用来论证一些方法设计的依据是否科学。

在假阳性结果方面,从质评结果来看,假阳性率较低,出现 2 例或 2 例以上假阳性的实验室共 7家(0.8%,7/844)。实验室污染(扩增产物遗留污染和标本间交叉污染)在少数实验室存在。部分试剂存在和其它冠状病毒的交叉反应。

综上所述,临检中心最后对当前各实验室需要改进的方面进行了总结:建议各试剂厂家根据目前临床应用情况,总结临床性能的数据;自建方法应加强对试剂性能的评价;临床实验室在开展检测前或更换试剂批号时,应进行性能验证,以发现不同试剂批号存在的差异以及验证实验室 检测能力;临床实验室应使用参与核酸提取过程的弱阳性样本和多份(如3份)阴性样本,进行室内质量控制,以有效监测实验室对弱阳性样本的检测能力和实验室污染;临床实验室人员应加强实验操作和结果解读能力的人员培训。
参考资料:

1. 临检中心《全国新型冠状病毒核酸检测室间质量评价结果报告》

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本文由 测序中国 作者:陈初夏 发表,转载请注明来源!

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