东南大学陆祖宏团队成功解析首批染色体水平的高质量石珊瑚基因组图谱 白云 科研 2024-03-29 该研究利用新的工作流程和高通量染色体构象捕获(Hi-C)技术,实现了技术突破,成功组装了世界首批染色体水平的高质量石珊瑚基因组。
BioNeMo模型扩展到基因组学!英伟达推出生成式AI药物设计和蛋白质预测项目 白云 产业, 资讯 2024-03-29 英伟达计划将扩展后的BioNeMo模型作为一系列基于云的企业服务提供给客户,并通过AWS HealthOmics平台提供药物分子结合和蛋白质结构变化的预测指标。
Genome Bio| 灵敏、快速的基因组污染检测新工具FCS-GX,可自动去除污染序列、提高数据质量 白云 科研 2024-03-29 该研究介绍了一种新的基因组跨物种比对工具FCS-GX,可利用h-mer匹配和编辑的参考数据库识别外来生物的基因组污染,运行快速、精度高和污染物的自动去除是其核心特征。
Nat Commun | 王少璞/母得志/牛晓宇绘制生命早期人类肠道病毒组最全面、完整的宏基因组图谱 白云 科研 2024-03-29 该研究建立了生命早期人类肠道病毒组目录ELGV,该目录包含160,478个专门针对生命早期人类的肠道病毒基因组序列,约涵盖82,141个物种、11,413个属和1238个家族水平的病毒。
Nat Commun | 单细胞水平检测染色体外环状DNA多样性及复杂性的新工具scCircle-seq 白云 科研 2024-03-29 scCircle-seq利用滚环扩增(RCA)和DNA缺口修复步骤来实现高检测灵敏度,不仅可以检测丰富的、包含癌基因的eccDNA,还可以检测罕见的eccDNA。
Cell | 综合泛癌蛋白基因组学分析揭示跨越10种癌症类型的7种免疫亚型 白云 科研 2024-03-22 该项研究分析了10种癌症中1000多个肿瘤样本的蛋白质组学特征以及匹配的基因组、表观基因组和转录组特征,以全面表征这些肿瘤的免疫景观,并利用组织病理学、数字病理学和患者临床注释进行了补充。
JAMA子刊 | 临床研究表明,基于NCCN指南靶向突变的组织与ctDNA并行检测具有临床益处 白云 科研 2024-03-22 美国国立综合癌症网络(NCCN)的临床指南建议通过基于组织的下一代测序(NGS)进行全面的基因组分析。与非靶向治疗相比,通过检测肿瘤样本的关键突变基因可以帮助确定靶向治疗方案。除此之外,通过液体活检对循环肿瘤DNA(ctDNA)进行…
Nat Cancer | 邵志敏/江一舟/黄薇/郑媛婷团队发表大型中国乳腺癌患者队列多组学研究成果 白云 科研 2024-03-22 综上所述,这项研究提供了一个由773例中国乳腺癌组成的综合多组学队列,包括基因组、转录组、蛋白质组、代谢组、放射组和数字病理学数据。该数据集有助于识别乳腺癌的潜在治疗靶点、种族差异、TME和代谢特征,揭示亚洲乳腺癌的独特特征,并为未…
Sci Transl Med | 机器学习+扩增子片段组测序实现灵敏的癌症早期检测 白云 科研 2024-03-22 针对癌症的早期检测,研究团队相信A-PLUS能够成为比现有基于表观遗传学和片段组学检测方法更简单、更有效的新工具。