宏基因组测序技术助力腹泻暴发调查中病原体识别 白云 科研 2021-08-09 宏基因组测序在探索腹泻样本中的病原体时,是一种全面系统、无偏、更灵敏的方法,可为未来快速诊断腹泻暴发中的病原体、乃至进一步精准防控提供技术基础和依据。
宏基因组测序技术助力腹泻暴发调查中病原体识别 白云 科研 2021-08-09 宏基因组测序在探索腹泻样本中的病原体时,是一种全面系统、无偏、更灵敏的方法,可为未来快速诊断腹泻暴发中的病原体、乃至进一步精准防控提供技术基础和依据。
加州大学钟声教授团队开发高通量蛋白互作检测技术,快速绘制人类蛋白互作图谱 | Molecular Cell 白云 科研 2021-08-09 利用PROPER-seq方法,研究团队构建了人类 PPI参考图谱,包括210518个PPI,涉及8635种蛋白质,证明该方法是一种可在转录组水平绘制PPI图谱的高效技术。
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Science | 空间转录组学新方法—sci-Space,实现单细胞分辨率绘制基因表达图谱 白云 科研 2021-08-09 研究团队利用获得的空间分辨单细胞数据,开发了一种统计方法来识别发育中胚胎空间调控基因表达的细胞类型,并发现了新的神经元迁移模式。
Science | 空间转录组学新方法—sci-Space,实现单细胞分辨率绘制基因表达图谱 白云 科研 2021-08-09 研究团队利用获得的空间分辨单细胞数据,开发了一种统计方法来识别发育中胚胎空间调控基因表达的细胞类型,并发现了新的神经元迁移模式。
UK Biobank全外显子精细定位分析,揭示新的性状相关罕见编码变异 白云 科研 2021-08-09 研究团队通过依赖UKB队列中的单倍型共享,将外显子组范围的变异输入到整个队列中,共分析了54个数量性状,最终确定了1189个显著的性状变异关联,包括影响身高的罕见变异。
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Cell Reports | 基于大规模转录组数据,系统比较四种降维算法分析样本异质性 白云 科研 2021-08-09 研究团队建议在分析较大样本量的转录组测序数据集时采用UMAP降维算法,加强样本聚类异质性研究和基因表达差异分析。
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新技术!蛋白-DNA交互作用在单分子水平迎来重要突破! 白云 科研 2021-07-27 该文章介绍了一种基于构建葡萄球菌蛋白A-甲基转移酶融合重组蛋白,对抗体结合的组蛋白修饰、DNA结合蛋白附近的DNA进行特异性定点甲基化修饰,并通过长读长测序,获得高精度的、DNA单分子水平上的组蛋白修饰及DNA结合蛋白序列信息。
新技术!蛋白-DNA交互作用在单分子水平迎来重要突破! 白云 科研 2021-07-27 该文章介绍了一种基于构建葡萄球菌蛋白A-甲基转移酶融合重组蛋白,对抗体结合的组蛋白修饰、DNA结合蛋白附近的DNA进行特异性定点甲基化修饰,并通过长读长测序,获得高精度的、DNA单分子水平上的组蛋白修饰及DNA结合蛋白序列信息。
NAR|北大/中科院计算所团队发布基因功能富集分析平台KOBAS-i 白云 科研 2021-07-27 北京大学孔雷课题组与中国科学院计算技术研究所赵屹研究员课题组合作开发的基因功能富集平台KOBAS-i
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Nature Genetics | 李蔚教授开创性提出多聚腺苷酸化(APA)关联遗传位点,基因表达分析增添新维度 白云 科研 2021-07-22 分别从组织水平与单细胞水平证明了APA关联遗传位点(3′QTLs)对于细胞正常生理过程及疾病发生发展的重要作用。3′QTLs分析可解释与遗传相关的绝大多数疾病,包括肿瘤、阿尔兹海默及糖尿病等;独创的scDaPars算法可以精细划分单…
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阅尔基因和微软研究院开发深度学习模型,用于预测NGS测序深度 白云 科研 2021-07-22 深度学习模型(DLM),用于从DNA探针序列预测NGS测序深度。该研究是利用机器学习提高基因组学效率和准确性的最新成果。
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