科研

全基因组DNA甲基化揭示恶性儿童白血病患者的差异

12月19日,《自然 - 通讯》同时发表了两篇文章“RAS-pathway mutation patterns define epigenetic subclasses in juvenile myelomonocytic leukemia”和“Genome-wide DNA methylation is predictive of outcome in juvenile myelomonocytic leukemia”,两项研究鉴定出了青少年粒单细胞白血病(JMML)的三种新亚组,它们可以预测病人结果,包括最有可能发生疾病自行消退的病人。

JMML是一种罕见的侵袭性骨髓增殖性疾病,是由基因突变引起Ras信号转导过度导致的恶性癌症,治疗手段有限。目前的 JMML 临床和遗传标记不能揭示与该疾病相关的不同临床结果。DNA 甲基化在该疾病中扮演着重要角色。两项独立研究表明,这一表观遗传标记或有助于解释不同 JMML 病人的预后差异。

德国癌症研究中心的Christoph Plass、Daniel Lipka 及同事分析了 167 例 JMML 样本的 DNA 甲基化模式和突变情况,发现了三个甲基化水平各不一样(高、中、低)的亚组。甲基化水平高的病人,临床结果差;甲基化水平低的病人,预后良好。所有三组的突变情况都不一样,表明在 JMML 病人中,DNA 甲基化机制的激活与突变模式存在关联

美国加州大学旧金山分校的Elliot Stieglitz、Mignon Loh 及同事研究了 39 名病人的 DNA 甲基化,独立鉴定出三个 DNA 甲基化亚组,其中高甲基化水平与不良临床结果相关,而低甲基化水平与良好预后相关,他们在另外 40 名病人身上也验证了这一结果。

该研究为根据 DNA 甲基化划分不同 JMML 患者奠定了基础,有助于我们进一步了解 JMML 的基础生物学机制。

论文原文网址:

https://www.nature.com/articles/s41467-017-02177-w

https://www.nature.com/articles/s41467-017-02178-9

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