21世纪以来，新发突发病原体引发的流行性疫情是公共安全的主要威胁，严重影响了全球健康可持续发展。特别是冠状病毒的频繁新发、流感病毒变异重组多发和环境中病原体的潜在暴发，让人们意识到全面建立病原学为基础的监测预警平台的重要性。基于对国内公卫领域的病原监测急切需要的了解，微远基因依托多年病原学技术及产品开发经验，结合开创性的变异检测加速算法、多维度病原分子分型数据库、以及新发病原预警模型等关键性分析技术，打造一款本地化、自动化、智能化的微生物基因组快速分析系统Solar System。

该系统围绕病原学监测预警中“识别病原、识别暴发、识别来源”的三大功能性分析方向，专门依据国人的软件使用习惯而设计，提供点选式、全中文的可视化操作界面，一键完成下机数据质控、基因组分析及报告输出等全流程，为全方位病原学监测预警能力的建设，奠定了智能自动化数据分析的坚实基础。

微生物基因组数据分析能力建设，会遇到诸多挑战及困局，面对从繁多分析软件中找到合适的流程，避免公共数据序列污染及错误，保证非专业人员快速掌握生信数据分析能力，以及确保数据安全等一系列问题，如何快速建立全方位病原学监测预警平台的数据分析与处理能力，微远基因“Solar System微生物基因组快速分析系统”将给出详细答案。

值得关注的是，近期在2022年PDIS学术会议上，微远基因正式推出“建库+测序+分析”新冠快速溯源综合解决方案，实现在10小时内完成从新冠核酸到分型报告的全流程，完全符合《新型冠状病毒肺炎防控方案（第九版）》中，对于本土疫情中首发、早期病例及流行病学关联病例等阳性样本，需进行全基因组测序，并24小时内开展测序工作的防控要求。

• 针对不可培养且有商品化扩增子建库试剂盒的场景，可采用“多重PCR靶向扩增分析”流程，同时该系统可友好兼容各类商品化的扩增子建库试剂盒。
• 针对可培养单菌株或单毒株的场景，可采用“培养株全基因组分析”流程。
• 针对不可培养且没有商品化建库试剂盒，需要直接进行样本检测的场景，可采用“宏基因组建库分析”流程。
• 针对微远基因宏基因组二代测序鉴定软件输出的结果中，目标病原丰度较高的场景，可直接采用“单病原分析-Mars源”流程，通过宏基因组鉴定用的测序下机数据，获取目标病原的全基因组序列，无需重新进行宏基因组建库。这个流程被整合在同一个分析系统中，极大方便了用户使用。

• 比如该数据库中收录的沙门氏菌，是常见的食源性致病菌，极易引起食物中毒，公共卫生意义重大，其血清型分型在病原学检测、菌株分型及常规监测中有着重要作用。X-Type分子分型数据库，包含沙门氏菌O抗原、H抗原和7个管家基因参考序列集，结合Kauffmann-White沙门分型系统进行分析，可对2670种沙门氏菌血清型和7766种ST型进行分析。
• 再如脑膜炎奈瑟菌，可引起流行性脑脊髓膜炎，多为隐性感染，病死率较高。数据库中共收录有12个血清群，人类疾病由其中6种（A，B，C，W，X和Y）导致。X-Type分子分型数据库，综合考虑该病原菌的60多个重点基因，能够快速鉴定出病原所属血清群，为公共卫生快速响应提供信息。
• 病毒如HIV，可导致人体不同程度的免疫功能缺陷，未经治疗的感染者可并发各种严重感染和恶性肿瘤，最终导致死亡。它具有极高的突变率与重组率，如果只考虑进化距离将无法鉴定其重组型。X-Type分子分型数据库，使用经过优化的SlidingWindow(滑窗法)对HIV病毒进行精准分型，可同时兼顾碱基突变与流行株间的重组，并对20种HIV亚型及由此衍生的39种不同流行重组型进行分析。