产业

首页 - 全部文章 - 产业 - CSCO 2020丨思路迪卫星会大师论道:肿瘤精准检测技术和实际临床应用的辩与证

CSCO 2020丨思路迪卫星会大师论道:肿瘤精准检测技术和实际临床应用的辩与证

疫情阻挡不了学习的脚步,病毒隔离不了学术的氛围。2020年9月19日,第23届全国临床肿瘤学大会暨2020年CSCO学术年会隆重开幕。为了配合疫情防控工作,大会首次采取以网络直播为主、部分现场参会为辅的“线上线下,双线并行”的创新模式,在北京、上海、广州、哈尔滨、武汉分设五个会场,按不同肿瘤专业领域进行学术交流,为肿瘤医生同道间的学术交流提供了更为广阔的平台。

今年CSCO年会的主题为“精准诊治,携手共赢”。作为国内肿瘤精准医疗领域的领先企业,思路迪公司于9月21日12:30-13:30在线举办了主题为“大师论道:肿瘤精准检测与临床应用”的专场卫星会。会议分别从肿瘤精准检测的行业篇及临床科研篇阐述了全国临床肿瘤大家对该行业的见解和期待,同时思路迪针对专家的意见和建议进行了两个主题的汇报演讲。

01

大师论道:技术、产品与临床在碰撞与融合过程中的破和立

本次卫星会邀请到二十余位全国不同肿瘤领域的重磅嘉宾,分别为胃肠肿瘤领域专家:北京大学肿瘤医院季加孚教授、北京大学肿瘤医院沈琳教授、天津肿瘤医院梁寒教授、北京大学人民医院叶颖江教授、北京大学肿瘤医院李子禹教授、北京大学肿瘤医院张小田教授、北京大学肿瘤医院李健教授;胸部肿瘤领域专家:中国医学科学院肿瘤医院王洁教授、上海交通大学附属胸科医院韩宝惠教授、北京大学肿瘤医院吴楠教授、中国人民解放军总医院胡毅教授、北京宣武医院张毅教授;肝胆胰肿瘤领域专家:北京大学国际医院梁军教授、上海交通大学医学院附属仁济医院王理伟教授、北京大学肿瘤医院郝纯毅教授、广东省人民医院陈汝福教授、中华预防医学会肝胆胰疾病预防与控制委员会主任委员卢实春教授;生殖系统肿瘤领域专家:西安交通大学第一附属医院贺大林教授、中山大学孙逸仙纪念医院林仲秋教授、天津肿瘤医院姚欣教授、四川省华西医院曾浩教授,以及思路迪副总裁白跃宗和医学市场部副总监赵晓忱,共话肿瘤精准检测与临床应用。

图:思路迪2020 CSCO卫星会大师论道嘉宾和讲者

经历数年发展,如今NGS技术已不仅仅停留在技术参数层面,而进入了临床应用的新时代。思路迪在CSCO 2019期间就举办了“基因检测2.0时代:疗效验证才是王道!”的主题卫星会。然而所有技术最终都要回到临床应用上,那么近年来基因检测行业的迅猛发展究竟得到了临床肿瘤专家的多少认可呢?他们对这一行业的发展趋势有着怎样的观点?他们对基因检测在临床和科研中的应用有哪些体会和建议?对于基因检测公司的合作他们又将如何选择呢?

针对这些问题,思路迪发起了CSCO 2020卫星会专题——“大师论道:肿瘤精准检测与临床应用”,通过针对21位全国肿瘤一线大咖级专家的深度访谈,更加直观地了解了肿瘤基因检测在临床上的实际应用状况以及需要进一步完善的不足之处。具体访谈内容详见思路迪公司持续发布的系列报道。

图:大师论道系列报道

02

进无止境:一切技术和产品的求索与精深皆源于临床的辩与证

与此同时,针对这些大咖们的意见和期待,思路迪公司也分享了其洞察和答案。来自思路迪的副总裁白跃宗先生给大家带来了主题为《从【双C验证】到【双重验证】——铸造最可信赖的精准检测产品与服务》的大会报告。

图:白跃宗介绍从【双C验证】到【双重验证】

针对大家在访谈中都反复提到的问题:临床中越来越广泛的使用NGS技术,有如此之多的NGS公司,应该选择哪家呢?面对有着如此众多panel、涵盖组织和液体活检的产品,如何从不同的维度来进行选择呢?白跃宗先生在卫星会上从思路迪公司角度分享了他的答案。

对于第一个问题,白跃宗先生认为,临床应优先选择经过CAP和CLIA认证的实验室。最新的NCCN指南,已经推荐了NGS的检测需要在通过CLIA认证的医学检验所进行。在中国数以百计的NGS公司里,只有7家第三方临检所拥有CAP和CLIA“双C”认证,而思路迪是中国最早获得CAP认证和CLIA双C认证的国内的第三方临检所之一。除了CAP认证和CLIA认证以外,还有大量的其它官方认证体系,思路迪也一直在与相关权威机构合作,来对其实验室的技术和平台进行认证。

第二个问题,在通过双C认证的实验室里,面对不同的检测产品应该如何选择呢?白跃宗先生分享了一个简单的标准,即参考这些产品和生物标志物是否经过了技术和临床的双重验证。他介绍,思路迪是中国国内首批开展肿瘤组织NGS检测平台进行技术和临床验证的第三方临检服务机构,在2017年就已经将超过300例大样本的临床验证的数据发表在SCI杂志上。同时,思路迪也是国内开展首项大规模ctDNA配对验证研究的机构,2018年在BMC上发表了超过137对组织和血液一致性的研究的结果。除了组织和血液检测平台的验证,在免疫治疗的生物标志物上,思路迪同样进行了技术和临床验证,分别开展了第一个中国人群NGS-MSI预测免疫疗效的研究的技术验证,并在此基础上开展了中国人群血浆检测bMSI预测免疫疗效的研究的临床验证。除此之外,思路迪还在2018年于JAMA Oncology发表第一个针对中国人群bTMB预测免疫疗效的研究,该研究首先完成的也是技术验证,并在此基础上完成了临床疗效验证。

最后,白跃宗先生总结,思路迪检验所是国内少数几家获得双C验证的实验室,并且无论是组织还是血液检测产品和标记物都经过双重验证,因此在质量和临床上都是值得信赖的合作伙伴

随后,思路迪医学副总监赵晓忱博士给大家带来了主题为《Super-Seq(Suppress digital errors)深亦可测,看见冰山“另一角”》的报告。

图:赵晓忱介绍Super-Seq(Suppress digital errors)深亦可测,看见冰山“另一角”

赵晓忱博士表示,各位专家对ctDNA目前在临床上应用前景和存在的一些问题,提出了很多宝贵的意见和建议。思路迪一直以来充分重视专家从临床角度发出的声音,并时刻运用到日常产品的开发之中。那么,针对ctDNA技术的开发和验证,思路迪究竟做了哪些工作,才能做到看见冰山藏在水面以下的那一“角”呢?

众所周知,血液ctDNA检测在临床中应用广泛,其优点也十分明显。首先,由于其相对无创,可以克服肿瘤的空间和时间的异质性,是组织检测一个有效的补充。其次,ctDNA检测在临床应用的广泛性以及准确性,它既能做分子分型,又能做动态监测。最后,血液ctDNA检测还能够反映术后的MRD,因此可以监测疾病的治疗的疗效。基于这些优点,以ctDNA为基础的精准诊断存在于临床的各个诊疗决策环节。

但事实上,ctDNA的临床应用目前依然还存在一些问题。首先,肿瘤释放在血液中的ctDNA的突变频率是参差不齐的,存在大量低频的变异,尤其是肿瘤早期的患者,低频变异就非常多,这就需要很高的技术要求。其次,在NGS检测的过程当中,比如在文库的制备PCR扩增错误、探针杂交捕获过程中的分子氧化损伤错误等都会影响ctDNA的检测准确性。因此如果检测的平台的技术不过关或者算法不可靠的话,那么很可能最终拿到的是假阳性的结果。

那么如何才能克服这些问题呢,赵晓忱博士介绍,思路迪是通过独家的Super-Seq技术,即饱和式测序来实现的。具体而言,该技术主要涵盖以下几个方面要点。

首先,该技术采用双端UMI的体系。UMI是一个分子标签,是在DNA的序列上增加一个分子标签,它会随着肿瘤的DNA序列一起扩增、测序。最后做数据分析的时候,通过软件就可以很清晰地判断出来哪些变化是因为扩增或者建库错误导致的,哪些是真正突变。

然而,仅仅采用UMI技术增加准确性是不够的,为了抓到那些低频突变,还需要通过35000X的超深度测序,将检测LoD稳定在1‰的水平。

但是增加测序深度可能会带来更多的噪音,也就是说可能产生出更多的假阳性突变。所以第三方面要点就是采用三重降噪的算法来保证低频位点检出的准确性。分别通过单链一致序列分析和双链一致序列分析,剔除在测序、扩增建库的过程中可能出现的一些假阳性的位点。同时运用中国人群大样本数据库,再进行一个背景抛光,通过这样的三重降噪,来保证最后得到的变异信息都是准确的变异信息。

此外,思路迪也将Super-Seq同国际上知名的ctDNA检测公司进行了一个对比,通过双端UMI的体系,35000X测序深度及三重降噪的算法可以使得测序的LoD稳定的到达千分之一,从而实现为早期到晚期的肿瘤患者,从用药的指导以及预后的监测以及耐药信息的探寻上面提供更多更准的信息。

03

结 语

肿瘤精准医学之路,从来不是一条坦途,临床应用的融合之路,亦离不开临床专家的参与和支持。思路迪表示,作为肿瘤精准医疗领域的引领者,其一直期待能够提供更好的产品和服务,能够和更多临床专家一起进行更深入的交流与合作,最终指导临床实践,使更多的肿瘤患者获益!

(0)

本文由 测序中国 作者:戴胜 发表,转载请注明来源!

热评文章