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精准检测还需精准人群!中山大学附属肿瘤医院陈丽昆教授团队联合世和基因将携肺癌脑转移大型研究成果登上ASCO年会

前言

 

20%-65%的肺癌患者在确诊时即发生脑转移,由于颅内外病灶存在差异,《中国肺癌脑转移诊治专家共识》推荐脑脊液用于脑转移患者的基因突变检测,然而,脑脊液的ctDNA检出率较低,不足60%,盲目送检可能导致部分患者过度检测!如何进一步精准筛选出适合脑脊液检测的人群是目前临床亟待解决的难题。

为了解决以上难题,中山大学附属肿瘤医院陈丽昆教授团队与世和基因合作开展一项临床因素建立模型进行优势人群筛选的研究,相关成果被ASCO接收,并被选中为重磅口头报告(Oral Abstract Session)。

值得一提的是,自由投稿是ASCO年会科学研究交流中最重要的部分,按其重要性往下依次排列为:口头报告(Oral)、壁报讨论(Poster Discussion)、壁报展示(Poster)、摘要收录(Publication Only)。其中,口头报告(Oral)可谓每年ASCO会议的精髓所在。

    正文 

研究主要亮点

首次系统分析影响脑脊液ctDNA检出的临床因素特别是颅内病灶的特征信息,并开发临床简约模型进行优势人群筛选,最大化患者获益。对于优势人群通过脑脊液检测提示后续治疗策略;对于脑脊液检测劣势人群(不适合脑脊液检测)同样减少了等待时间,确保患者的及时治疗。

研究设计

该研究入组了未经治疗的67例晚期肺癌脑转移患者,收集详细的临床信息,包括:年龄、性别、病理分型、中枢神经系统症状、吸烟状态等;对患者进行颅脑增强MRI检查,对颅内病灶大小、病灶数目、病灶具体位置、病灶与脑室的距离进行了精确统计。同步收集患者的脑脊液和颅外组织样本进行世和基因425Panel检测,通过生物信息学方法分析具体的变异信息。

结合患者的临床信息和脑脊液变异信息分析可能影响检出的因素;进一步通过全子集回归(All subsets regression)筛选临床变量进行建模,利用交叉验证分析模型的稳健性,最终得到适用于临床上脑脊液送检患者筛选的简约模型。

主要结论

与既往研究近似,未经筛选的脑脊液样本ctDNA突变检出率仅为58%(39/67),提示临床上42%的患者可能为过度检测。通过脑脊液和颅外组织配对样本分析结果显示:脑脊液样本的突变图谱和颅外病灶存在较大差异,仅59%的配对样本中颅外病灶突变信息大于或等于脑脊液。

图1:颅外病灶和脑脊液检测突变图谱对比

进一步通过单因素分析发现:颅内病灶大小(Tumor_size,T)、最大病灶-脑室最短距离(Dtop)以及所有颅内病灶与脑室的最小距离(Dall显著影响脑脊液突变检出(p<0.05),此外患者存在中枢神经系统症状倾向于检出突变(p=0.24)。

表1:单因素和多因素分析可能影响CSF ctDNA检出因素

为了富集临床上真正适合脑脊液检测的患者,纳入临床信息通过全子集回归进行建模,结果显示:仅纳入肿瘤大小(T)和所有颅内病灶与脑室的最小距离(Dall具有最好的预测效果;通过7:3内部交叉验证,随机抽样100次,结果显示AUC和准确性分别达到0.8(0.74-0.87)和0.75(0.69-0.81)。此外,通过“留一法”验证AUC和准确性分别达到0.77和0.78。

图2:全子集回归确定最佳模型。A: AIC评估结果   B: BIC评估结果

基于此模型进行人群筛选后,排除了50.7%(34/67)可能从脑脊液检测无法获益的患者,优势人群中脑脊液ctDNA检出率从58%显著提高至81%(P=0.03)。
图3:人群筛选前后脑脊液ctDNA检出率对比

  总结

该研究建立了筛选脑脊液检测的临床简约模型,有效避免了临床患者的过度检测。脑脊液作为液态活检新的媒介,对脑转移患者的后续治疗至关重要。

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本文由 测序中国 作者:戴胜 发表,转载请注明来源!

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