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AGBT2020:CoolMPS测序数据披露,海外用户高度认可华大智造DNBSEQ测序平台

美国时间2月26日,在基因测序技术领域的全球盛会Advances in Genome Biology and Technology (AGBT)上,华大智造首席科学家Rade Drmanac博士联合多位海外科学家共同分享了基于DNBSEQ测序平台上的CoolMPS™测序数据
CoolMPS™是DNBSEQ平台上首款基于抗体的大规模平行测序试剂,它利用天然碱基来进行更清晰的碱基识别,有效避免传统测序方法中的DNA“疤痕”积聚对后续读取准确性的影响,实现更准确和更长的测序。该方法使得在每个测序循环中,与抗体相连的多个荧光染料分子能提供更高的信噪比;同时结合天然碱基,每个测序循环之间没有干扰,错误率低。

CoolMPS高通量测序试剂套装

华大智造首席科学家Rade Drmanac博士表示凝聚独特的DNB文库技术、低深度高精度的PCR-free技术、Patterned Array规则阵列技术,以及本次推出的基于抗体技术的CoolMPS™方法,有望重新定义大规模平行测序(MPS, Massively Parallel Sequencing),尽快实现百万基因组测序,迈入人人基因组时代。

华大智造首席科学家Rade Drmanac博士在AGBT上发表演讲

华大智造DNBSEQ测序平台获海外用户高度认可

英国癌症研究所肿瘤分析团队(the Tumour Profiling Unit at the Institute of Cancer Research in the UK)的Nik Matthews博士,基于华大智造DNBSEQ-G400测序平台,分别利用StandardMPS和CoolMPS测序反应通用试剂套装,进行了WGS全基因组分析。

Q30提升

“这完全让我感到震惊。”Nik说,“当我第一次看到数据结果时,我才发现,原来仅将测序试剂的化学方法更换为CoolMPS版本,就可以进一步提高Q30、降低错误率,也就是说,通过‘几乎不做任何事情’,就获得了更多的数据,这太酷了。”

错误率进一步降低

加拿大卑诗省癌症研究所(BC Cancer Agency)迈克尔史密斯基因组科学中心(Genome Sciences Centre,GSC)副主任、生物信息学负责人Steven Jones博士在他的实验室利用DNBSEQ™平台展开了一系列针对肿瘤样本的研究工作,包括WGS,RNA和单细胞ATAC测序。通过对比分析基于华大智造DNBSEQ-G400和Illumina HiSeq的下机数据,Steven博士表示:数据表明肿瘤基因组分析结果在不同平台间“基本一致”。特别是基于华大智造DNBSEQ-G400的PCR-free方法获得的WGS数据,在15X的测序深度就可以达到传统的PCR WGS 30X的数据质量,重复读取的次数则更少、产生的有效数据更多,更具成本效益。

蒙特利尔麦吉尔大学(McGill University)的基因组学负责人Jiannis Ragoussis教授在AGBT发表了关于在DNBSEQ-G400上评估单细胞RNA测序性能表现的主题演讲,并将该数据与Illumina NovaSeq 6000进行了比较。

结果表明,MGI DNBSEQ-G400和Illumina NovaSeq 6000这两个平台之间的性能可比,数据相似,而MGI DNBSEQ-400实际上更加灵活且实用“基于MGI平台,我们以可控的测序成本,获得了更多的reads数。我们不再囿于昂贵的试剂耗材而不得不混合多个文库。

高性能产品满足用户更高要求

PCR-Free是华大智造在2019年推出的一款文库制备技术,在测序全流程无PCR扩增,使用1μg 基因组DNA仅需3.5个小时就能获得高准确度的全基因组文库。相比于传统个人全基因组测序(WGS),利用MGIEasy PCR-Free DNA文库制备试剂套装获得的变异检测性能,尤其是InDel检测灵敏度和准确性等方面已达到业界领先水平,无PCR扩增错误累积,基因组覆盖均一性好,变异检测性能优。华大智造将在DNBSEQ G系列和T系列测序仪上陆续提供CoolMPS测序试剂盒,这项创新产品的发布和上市,将更好地满足用户需求,为科学研究和产业发展提供性能更高、质量更稳定、数据更精准的测序平台。
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本文由 测序中国 作者:戴胜 发表,转载请注明来源!

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