PNAS | 发现新环形RNA可调节胃癌中的选择性剪接,抑制胃癌转移 白云 科研 2021-09-08 该研究鉴定出一个新的环形RNA——circURI1,能够作为hnRNPM的调控因子,调节与细胞迁移相关基因的选择性剪接,并首次发现环形RNA能够通过调控基因的可变剪接参与肿瘤的转移过程。
Genome Biology | 新型机器学习神经网络ChINN,可基于DNA序列预测染色质相互作用 白云 科研 2021-09-08 ChINN方法能够使用DNA序列作为特征,预测来自人类基因组中开放染色质区域的染色质相互作用。C
破译4000年前古人基因组,华大智造MGISEQ-2000与Illumina X-Ten大比拼 白云 资讯 2021-09-08 华大智造MGISEQ-2000测序仪已广泛应用于各种组学研究,多篇报道证实了MGISEQ-2000平台的性能与Illumina系列相当,并且具有更灵活的读取长度选择、更高通量和更低成本。
【IF 11】PLOS Medicine: ctDNA MRD预测直肠癌新辅助放化疗反应和预后评估 白云 科研 2021-09-02 复旦大学附属肿瘤医院章真教授团队,采用世和基因ctDNA液体活检技术,对119例接受新辅助放化疗(nCRT)的局部晚期直肠癌(LARC)患者进行ctDNA检测,探究了连续ctDNA动态监测在预测直肠癌新辅助放化疗病理完全缓解(pCR…
SCITO-seq:用于单细胞蛋白质和多模式分析的超高通量平台 | Nature Methods 白云 科研 2021-09-02 SCITO-seq是一种简单的两轮组合索引方法,能够在单个微流控反应中对超过105个细胞中150个以上的表面蛋白质进行分析。SCITO-seq由于使用微流体细胞负载的自然有限稀释,呈现出两个明显的优势:最小化背景噪声,最小化库准备成…
Nat. Commun | 基于机器学习模型的全基因组cfDNA片段分析方法可精准诊断肺癌患者 白云 科研 2021-09-02 研究团队开发的DELFI分析方法可用于检测肺癌的全基因组cfDNA片段分析。研究结果表明,DELFI分析经济且高效,可用于预筛选肺癌的高危人群,增加肺癌的检出性,并减少不必要的后续成像检查和侵入性活检。
JAMA Oncology最新研究揭示儿童白血病新型生物标志物,双重缺失可提供更可靠预后预测 白云 科研 2021-09-02 首次报道了22q11.22染色体λ可变链区域的缺失与IKZF1突变共同决定了的B-ALL儿童患者的一个特定分类,且该类患者预后较差。该研究发现对儿童B-ALL的临床诊断、治疗及预后的评估具有重要价值。
嘉因生物CUT&Tag服务助力国内首篇大刺鳅性染色体起源研究 | Genome Biology 白云 科研, 资讯 2021-09-02 该研究结合三代测序和HiFi数据,从染色体层面上有效地组装大刺鳅单倍型基因组,并在此基础上对基因组信息进行了深入分析。
Nature Cancer | 结合WGS、RNA-seq、DNA甲基化的多组学分析揭示胃癌腹膜转移潜在治疗靶点 白云 科研 2021-08-26 研究团队对来自98名患者的恶性腹水样本及相应的肿瘤细胞系进行了全基因组测序(WGS)、RNA测序(RNA-seq)、DNA甲基化和增强子图谱分析。