目前，PacBio正在开发的产品和技术源于其两项高度差异化的核心技术，包括HiFi长读长测序技术和SBB™短读长测序技术。被收购的Apton是Super-Res™测序和单分子检测系统开发商。Apton正在开发一种高通量短读长测序仪，采用最先进的光学和图像处理技术，允许快速和精细成像，以实现在一个flow cell上对数十亿reads进行测序。在此基础上构建的测序仪可以运行多个flow cell，运行时间48小时产生超Q40的碱基达90%以上（或者错误率为万分之一）。资料显示，两家公司合并后，PacBio计划将其SBB™短读长测序整合到Apton的高通量测序仪中，以提供差异化的高通量测序仪。

图：Apton测序技术的特性。来源：Apton官网

根据收购协议，PacBio将向Apton提供约8500万美元的全股票交易预付款，其中包括约630万股PacBio普通股，额外的2500万美元股票、现金或股票和现金组合，以及与使用Apton技术的高通量测序仪相关的5000万美元，总交易价值约为1.1亿美元。

PacBio总裁兼首席执行官Christian Henry表示：“我对Apton正在开发的新型高通量测序平台方面取得的进展印象深刻，该平台有潜力提供大规模的低成本测序。通过将高精度SBB™测序技术与Apton的超分辨率光学和图像处理技术相结合，PacBio希望更快地实现高通量短读长测序平台的商业化。此次收购符合PacBio的发展战略，即与长读长测序平台一起开发短读长测序的多产品组合，使我们有机会在数十亿美元的测序市场中占据更大的份额。”

PacBio首席运营官Mark Van Oene表示：“在最初的试运行中，PacBio的SBB™测序系统与Apton系统实现了无缝对接，这真令人兴奋。收购Apton加快了我们的开发进度，且预计不会增加研发费用。我们可以快速开始将SBB™的化学物质整合到Apton的高通量测序仪器上，相信这将大大减少开发新平台所需的时间。目前，Apton已经交付了一个精细敏捷的系统，PacBio期待着快速跟踪这个新测序仪器的发展。此外，这恰逢Onso进入商业化阶段，Onso开发团队期待在这个新项目中发挥其专业知识。”

Apton首席执行官John Hanna表示：“在Apton，我们一直在不懈地追求成本和通量的进步，以满足高通量测序市场的客户需求。当PacBio发布其Onso台式测序仪时，它扩展了我们对高通量测序仪的想象。如果能够用SBB™这样的一流测序来补充Apton在光学方面的进步，我们就有可能开发出一种真正差异化的高通量短读长测序仪。”

图：Onso系统，来源：PacBio官网

图：Onso系统测序规格。Onso系统测序耗材包括flow cell（双通道），聚类试剂和测序试剂盒，用于支持200或300个测序周期和双index reads，来源：PacBio官网

对于Onso系统的商业化，Christian Henry表示：“当2022年宣布Onso平台时，我就知道它将改变基因组学的游戏规则。我们相信PacBio是唯一一家同时提供高度精确、native短读长和长读长测序技术的公司。这一独特优势将使我们能够为客户的需求挑战提供更完整的解决方案，并帮助研究人员在肿瘤学和疾病研究等领域获得新的见解。感谢麻省理工学院和哈佛大学Broad研究所、Corteva Agriscience和Weill Cornell医学院提供的宝贵反馈，帮助我们改进这一尖端系统并将其推向市场。”

Broad研究所转化基因组学高级主任Niall Lennon表示：“在过去的几个月里，我们测试了Onso系统，以了解如何在胚系和体细胞应用中获得高质量的序列数据。我们已经有了一些新的发现，很高兴看到这个平台走向市场。”

资料显示，Onso有潜力达到Q40+的精度水平，研究人员将有机会深入了解ctDNA研究应用，例如微小残留病（MRD）监测和其他需要高度敏感突变检测的应用。这可能帮助研究人员检测到其他短读长测序技术遗漏的罕见突变。

“自从开始在一系列不同应用中测试Onso系统以来，我们在实验室看到了令人印象深刻的数据质量，远远高于Q30的行业标准，”威尔康奈尔医学院的Chris Mason博士表示。“我们有几次运行的原始质量分数超过了Q50。Onso系统为研究和转化应用开辟了新的可能性，在这些应用中，准确性是成功的关键。”此外，这种精度水平也可以为常见的中通量测序仪应用增加价值，例如外显子组测序、单细胞RNA测序，以及支持遗传疾病和肿瘤研究的靶向panel。

值得关注的是，在同一天，PacBio还公布了其2023年第二季度财务业绩。在截至6月30日的三个月中，PacBio第二季度报告了创纪录的约4760万美元收入，较上年同期的3,550万美元增长34%。包括仪器收入为2990万美元，上年同期为1560万美元，主要受Revio系统的销售推动。第二季度实现47套测序系统的确认收入，包括45套Revio系统和2套Sequel IIe系统，去年同期为36套Sequel II/IIe系统。耗材收入为1370万美元，上年同期为1460万美元。服务和其他收入为390万美元，上年同期为530万美元。

来源：PacBio官网

随着基因测序市场的竞争日益激烈，在长读长测序领域不断创新的PacBio已经在布局发展短读长测序市场。上文提到，PacBio在2021年收购Omniome后开发了结合SBB™测序技术的Onso系统。SBB™测序技术的高准确率帮助Onso系统实现了>Q40的精度，并成功实现商业化，但Onso系统仍是一款中通量测序系统。对于封闭式测序系统，提高芯片密度和光学系统的灵敏度是提高测序通量的一个公认途径。Apton的超分辨率光学成像和图像处理技术，可以有效提高测序通量，这成为促使PacBio收购Apton的一个原因。更重要的是，两个系统可以直接集成，不会增加额外的研发费用。期待PacBio为基因测序领域带来更多惊喜。