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Illumina收购基因组数据压缩软件开发公司Enancio,持续降低数据存储空间及传输成本

当地时间7月16日,Illumina宣布收购位于法国的基因组数据压缩软件开发公司Enancio,具体交易条款并未披露。本次对Enancio的收购是继2018年5月收购NGS数据分析加速解决方案供应商Edico Genome、2020年6月收购云软件开发商BlueBee之后,Illumina在基因组大数据领域的又一项密集收购。

基因数据的存储及应用是基因科技发展的基石,尤其是当以基因组学、人工智能、云计算、大数据为代表的新兴技术相结合时,将会爆发出巨大的能量。但在基因数据的海啸之下,基因企业和科研工作者也面临着大数据传输、存储、计算和应用等多方面的挑战。

据悉,Enancio所开发的无损压缩技术可将Illumina测序系统产出的数据从50GB压缩到10GB,从而以类似5倍的比例降低数据存储成本。整个系统通过将reads比对到参考基因组来压缩DNA序列,使用压缩的二进制格式将reads编码为位置和差异列表。最终,用适合不同类型质量方案的距离编码器和背景模型,以无损方式对质量分数进行编码。本次收购完成后,Enancio的技术将直接集成到云数据交换平台DRAGEN上。该平台在Illumina收购Edico Genome公司后纳入至其产品组合,可将现成可编程门阵列(FPGA)技术与独有的软件算法相结合,以减少数据占用空间和获得结果的时间。除此之外,Enancio的技术还计划被集成到Illumina的云存储平台服务中。

Illumina在一份声明中介绍,其2019年在全球投入使用的15,000多个测序系统所生成的基因组数据量同比增长50%以上,总计高达150PB,相当于连续录制500年高清视频所产生的数据量。Enancio首席执行官Jennifer Del Giudice表示:“这场信息海啸既影响深远且复杂,但其中同样蕴藏着科学发展的无限可能。在与DRAGEN平台集成后,我们将使存储和数据传输更加人性化。”

Illumina全球产品开发高级副总裁Susan Tousi补充说:“Illumina如今拥有的DRAGEN平台是中业界最先进且差异化的辅助分析工具,具有与Illumina Analytics Platform(IAP)和BlueBee技术一起进行的可扩展的云数据交换,为我们的客户带来了经济高效、快速且简单的工作流程。Enancio和BlueBee加入后,Illumina现在拥有了卓越的数据云服务。”

值得关注的是,本次针对Enancio的收购距Illumina收购荷兰云端软件公司BlueBee仅一个月时间。一直以来,尽管HiseqX等测序平台的推出使得下游用户的测序成本快速降低,然而数据分析环节的时间成本和人力成本依然高昂。快速、准确、低成本的数据分析仍然是科研用户和临床用户共同的迫切需求。两项连续的收购将帮助Illumina简化用户的基因组数据解读的工作流程,进一步降低数据分析环节成本,从而解决用户的迫切需求。而这无疑将帮助Illumina进一步巩固在全球测序市场的领导地位,并加快基因组数据在临床中的应用。

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本文由 测序中国 作者:陈初夏 发表,转载请注明来源!

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