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生物信息暑期班(北京站)开始报名

2019年我们的生物信息培训班第四次来到北京。错过前两期培训的,不能在错过这次了,学习要趁早。本次培训依然采用五天教学,通过5天的系统学习,带您入门生物信息行业,让您熟练掌握Linux操作,测序原理,常用生物软件的使用,并能独立完成基因组,重测序,外显子分析等内容。让您对生物信息有一个全面的了解。培训之后,通过观看视频课程,继续使用服务器练习,巩固生物信息分析技能,让您今年彻底学会生物信息,助您尽快发表SCI。

课程特色

1、真正的小班授课,让每一位学员都执行出结果;
2、科学设计课程,循序渐进,课程包含Linux,测序原理,基因组分析,三代数据分析,重测序分析,外显子等,适合零基础开始;
3、以完整项目为案例,通过亲自上手操作,快速掌握技能;
4、赠送32G优盘,含有大量生物信息学习资料,可继续巩固学习;
5、赠送半年生物云服务器(32线程,256G,24T)使用权限,可继续巩固学习,也可以分析自己数据;
6、培训结束之后,可继续微信群答疑交流。

主讲老师

王通:曾任职于华大基因,9年以上生物信息分析经验,擅长基因组,转录组,宏基因组,肿瘤基因组等数据分析。曾任华大基因高级讲师。2015年开始创业,主要做生物信息培训工作。国内最早生物信息教学视频制作者,已制作视频500集以上。目前已在北京,深圳,哈尔滨,杭州,武汉,南京,长春,上海,广州,青岛等组织过多场培训班,线上线下累计学员超过6000多名。公众号“基因学苑”作者,已写作生物信息教程180多篇。

课程安排

(根据现场情况适当调整进度)

日期 主题 课程安排
第1天

(上午)

生物信息学简介及Linux操作 生物信息学简介

登录服务器

传输文件

常用Linux命令

选项参数

目录结构

权限管理

第1天

(下午)

生物软件安装 vim编写脚本

sh执行脚本

生物软件下载与安装

bioconda管理生物软件

PATH变量设置

第2天

(上午)

生物数据下载 参考序列下载

数据库下载

SRA数据下载

批量下载数据

GTF文件下载

第2天

(下午)

测序原理及数据质控 测序原理

一代测序

二代测序

三代测序

fastq文件格式

fastqc数据质控

数据过滤

进程管理

第3天

(上午)

基因组拼接 kmer估计基因组大小

基因组拼接原理

二代测序基因组拼接

基因组统计

QUAST评估组装质量

如何改善拼接效果

批量操作

第3天

(下午)

三代测序数据处理 nanopore数据质控过滤

Nanopolish进行组装错误校正

canu拼接nanopore数据

pacbio测序数据拼接

minimap2 比对参考序列

tablet可视化比对结果

第4天(上午) 基因组分析 基因预测

ncRNA分析

重复序列分析

基因功能注释

基因家族分析

第4天

(下午)

比较基因组分析 nt库比对鉴定物种

nr库比对基因功能注释

多序列比对

构建系统发育树

利用iTol美化系统发育树

第5天

(上午)

基因组变异检测 变异检测原理

bwa比对

bam文件格式

samtools工具处理sam/bam格式

第5天

(下午)

基因组变异检测 利用freebays筛选SNP

bcftools工具处理vcf/bcf文件

利用IGV可视化比对结果

SNPeff注释工具

annovar工具

报名须知

时间:2019年7月27 ~ 7月31日(五天)每天早上8:30~17:30

上课地址:北京市海淀区辰茂鸿翔酒店(地铁10号线牡丹园地铁站附近)

请自带电脑(windows与mac系统均可),提供午餐。

付款方式

培训费用:4900元

付款方式:银行对公转账

单位名称:中科国测(北京)科技有限公司

开 户 行 :中国建设银行股份有限公司北京中南路支行

银行账号:11050163870000000021

可以现场刷卡或扫码支付等,会议通知等请联系工作人员。

报名方式

扫描下方二维码,填写报名信息。

咨询电话:010-57178481

电话:156 4253 9895

 常见问题

1、零基础是否可以学会?

完全没有问题,我们本次培训班就是针对零基础学员,或者刚刚接触生物信息的学员,不要害怕自己是零基础,如果不学习,永远都是零基础。

2、上完课就能够自己做分析了吗?

可以,我们课上会演示大量操作案例,将脚本以及案例数据放到服务器上,只需要替换为自己数据即可完成分析。

3、赠送的服务器账号是做什么的?

生物信息分析需要大量的计算资源以及部署软件数据库,赠送的服务器在大家学习完成之后,可以使用该计算资源进行自己的数据分析,而无需继续购买计算资源和花费大量时间部署软件和数据库。

4、可以开发票吗?

可以,包括培训通知等,方便用户报销。

5、需要做哪些准备?

课程开始之前会发送在线视频和讲义,让用户预习Linux操作。

6、培训完后面有不会的问题怎么办?

生物信息学习是一样长期的任务,培训班结束了,学习并没有,我们有培训交流群,后续可以在群内继续交流学习。

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本文由 测序中国 作者:陈初夏 发表,转载请注明来源!

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