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精彩回顾,亮点纷呈丨2018单细胞测序技术应用研讨会圆满闭幕!

2018年6月29日由北京博奥晶典生物技术有限公司(以下简称博奥晶典)主办,BD(中国)作为金牌赞助的2018单细胞测序技术应用研讨会在北京希尔顿逸林酒店成功举办。

本次大会分为两部分:第一部分:由8位单细胞领域权威专家作为大会报告嘉宾,围绕单细胞测序技术在干细胞领域、肿瘤领域、发育、心血管疾病、生殖领域等应用方向进行专题报告;第二部分:由博奥晶典的生物信息工程师为参会学者分享了数据分析的常用软件和晶典在众多实战项目中的经验。为国内广大单细胞研究的科研学者提供了相互交流的高质量平台,为单细胞前沿技术在生物科技领域的探索实践做了高效推动。

近300名代表参加本次会议

总共有来自北京、天津、河北、上海、河南、山东、浙江、江苏、福建、广东、湖南、湖北、黑龙江、辽宁、陕西15个省市,21所大学、26家研究机构、34家医院的近300位参会嘉宾出席本次会议。

北京博奥晶典生物技术有限公司首席执行官许俊泉进行开幕式致辞

北京博奥晶典生物技术有限公司首席执行官许俊泉先生为本次会议进行了开幕式致辞。许俊泉先生表示单细胞测序技术作为探索细胞异质性的革命性技术,为基础研究和临床应用带来了新的展望。借此机会,博奥晶典举办本次盛会,会议主旨为国内单细胞测序技术开发和应用的科研学者提供相互交流的平台。

大会报告精彩回顾

邓宏魁教授

北京大学博雅讲席教授、长江特聘教授,北京大学干细胞研究中心主任邓宏魁教授作了题为“化学小分子操控和重塑细胞命运”的专题报告。邓教授在报告中详细介绍了课题组在体细胞重编程研究领域的系列工作,以及使用10X Genomics单细胞转录组测序技术发现了体细胞重编程过程中一个新的中间状态的细胞类型,该细胞亚群具有两细胞(2C)胚胎样转录特征,并阐述了其在细胞多能性获得中的关键作用,相关研究结果发表在国际干细胞顶级杂志《Cell Stem Cell》(详情请阅读:重磅 ∣ 10X Genomics又一力作,博奥晶典联合北京大学体细胞重编程机制研究登顶《Cell Stem Cell》)。

潘星华教授

广州南方医科大学生物化学与分子生物学特聘教授、广东省单细胞技术与应用重点实验室主任,兼任美国耶鲁大学遗传系顾问潘星华教授在大会上做了题为“单细胞测序的进展和前景”的专题报告。潘教授对目前单细胞测序在基因组、转录组、表观组的方法做了详细的综述,总结近年来单细胞测序技术在干细胞、癌症、免疫、神经和发育等领域应用所产生的一些重大成果。潘教授课题组在单细胞测序技术的研发和应用上硕果累累,报告期间展示了他们的部分成果。此外,潘教授陈述了单细胞测序目前所面临的一些瓶颈和挑战,为我们将来使用单细胞测序技术更好的服务于基础研究和临床应用做了新的展望。

蔡涛主任

北京生命科学研究所测序中心主任,北京市“海聚工程专家人才”蔡涛主任做了题为“肺泡发育中新细胞类型的鉴定”的报告。蔡涛主任在报告中详细介绍了使用10X genomics单细胞转录组测序技术在研究小鼠肺泡I型细胞发育中获得的新发现,相关的研究结果发表在《PNAS》(详情请阅读:《PNAS》博奥晶典助力国内科研人员应用10X单细胞转录组技术解析肺泡一型细胞亚型异质性)。并且,为参会嘉宾总结了做单细胞转录组测序中的一些经验和教训,如:细胞质量将直接影响结果的好坏,在开展单细胞的研究中应尽量避免混样,控制因细胞混合带来的复杂地数据解析过程。

王文会 副教授

清华大学副教授、青年千人王文会博士做了题为“用于单细胞操作与分析的微器件和系统”的报告。王博士详细介绍了其课题组结合微器件与显微操作系统,对细胞等微米级的对象进行操作的相关工作和进展。包括细胞注射/取放系统、细胞力/粘附测量、细胞三维旋转/成像/ 机电特性测量、细胞捕获与图形化等。通过这些操作实例,展示出微器件与系统在研究单细胞的巨大潜能,为其他老师对单个细胞的研究开拓了更多的思路和方向。

文路 副研究员

来自北京大学汤富酬教授课题组的文路博士为我们带来了“单细胞多重组学测序新技术及其应用”的报告。文路博士介绍了其课题组开发的一种单细胞表观基因组平行多组学测序技术scCOOL-Seq,该技术可以同时对单细胞进行染色质状态、DNA甲基化和基因组拷贝数变异等多组学层面分析,并介绍了使用该技术在小鼠与人类着床前胚胎发育过程进行的研究成果。此外,文路博士还介绍了另一种单细胞三重组学测序技术scTrio-Seq,它能够从一个单细胞中同时获取基因组拷贝数变异、DNA甲基化组和转录组三层面组学信息,并分享了其应用于分析肝癌与结直肠癌肿瘤异质性的研究结果。通过实际应用案例,为各位老师开展单细胞多组学研究提供了新的方法。

聂宇 副研究员

中国医学科学院阜外医院,心血管疾病国家重点实验室,副研究员聂宇博士做了题为“单细胞测序解析心肌再生分子机制”的报告。聂宇博士通过风趣幽默的语言介绍了为什么要开展心肌再生的研究,该研究在临床治疗的重大意义,以及他们在该领域所取得的重要成果。最后,介绍了他们使用单细胞测序技术在心肌再生机制研究方面目前所取得的进展。

林巍 博士

达拉斯贝勒医学中心免疫研究所(BIIR@Dallas, TX)基因组学和生物信息学研究室主任、亚利桑那转化基因组研究所 (TGen@Phoenix, AZ) 资深顾问林巍博士主要从事单细胞测序数据分析内容的开发工作。林巍博士的报告对单细胞转录组数据的当前分析策略进行总结,尤其是结合其团队所开发的监督学习细胞分型方法以及已有的非监督聚类和细胞时序轨迹分析方法,提出了推进的单细胞多谱系和目标谱系的分析路线图。在展示该分析路线过程中,他以高度异质化的肿瘤组织为例进行深度解析。首先将肿瘤细胞和微环境细胞区分出来并揭示其相互作用、以及富集的信号通路。在此基础上,对于肿瘤细胞谱系的演化特点做更为细致分析。通过对肿瘤细胞的时序轨迹分析,展示了大量推进肿瘤EMT转化基因。

张怡然 博士

生物芯片北京国家工程研究中心健康科学研究院张怡然博士,进行了题为“单细胞测序技术与肺癌细胞图谱研究”的报告。张怡然博士详细介绍了他们搭建的一套针对肺癌病人外周血及胸水CTCs的分离检测流程,通过单细胞多组学测序技术,发现与正常组织相比CTCs 存在特异表达基因,进一步转录因子富集分析发现,这些特异表达基因被干细胞因子所调控。利用这些信息,向肿瘤培养基中添加维持干性的细胞因子,使肿瘤原代培养的成功率大幅提高,并且在短时间内可以获得大量肿瘤细胞进行体外的药物敏感性测试,为临床提供了宝贵的信息。

数据分析培训班精彩呈现

单细胞测序后往往拿到每个样品几百 G 的数据量,如何从这些大规模的数据中更有效地挖掘数据、整理数据十分重要。来自博奥晶典的生物信息工程师方彬彬分享了:对单细胞测序技术在实际科研中的应用,在实验开展期间数据分析和挖掘过程中的难点问题进行了全方面经验分享,参会嘉宾对培训内容的干货分享表示了高度认可。

博奥晶典生物信息分析工程师 方彬彬

会议持续到晚上8点,参会嘉宾的热情依然高涨。

培训班现场的火爆场面

2018单细胞测序技术应用研讨会借此圆满结束,会议围绕着单细胞测序探讨了其在干细胞、再生、发育、分化等领域的应用;讨论了单细胞测序研究的方法现状并做了未来展望。作为生命科学领域高速发展的特色技术,我们也期待它更多的应用到科研领域研究,更低的成本消耗,为基础科研和临床应用带来更多的成果!明年再见。

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本文由 测序中国 作者:陈初夏 发表,转载请注明来源!

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