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10x Genomics公司最新推出多组学单细胞分析产品,旗舰产品引入重大改进

近日,基因组学领域领导者10x Genomics公司在圣迭戈召开的2018年美国人类遗传学会年会(ASHG)上详细阐述了新的技术和解决方案。这种向单细胞多组学分析的转变或将对基因组研究的未来产生重大影响。10x Genomics公司表示,这一系列全新解决方案的推出印证了公司在应用领域不断推陈出新的承诺,为科学家们在疾病、诊断和治疗领域的全新认知铺平道路。

全新的Chromium™ Single Cell ATAC Solution是该公司近期收购Epinomics公司后推出的首款产品。该产品也是第一个适用于快速且大规模并行分析单细胞表观基因组特征的商业化解决方案。此外,该方案包括功能全面的软件,可实现大规模单细胞ATAC-seq实验的快速分析及可视化。

“测序技术的创新加深了我们对基因组的了解,但是以单细胞为基础的调控机制与基因表达的直接关联尚未得到证实,”加州大学欧文分校医学院的助理教授、人类细胞图谱(Human Cell Atlas)计划研究人员Kai Kessenbrock博士表示,“我们实验室计划将新推出的Chromium Single Cell ATAC Solution作为常规使用,这将有助于我们研究与基因表达并行的调控机制,从而大规模揭示复杂生物学背后的真相。”

除了ATAC-seq和单细胞CNV,该公司还在今年早些的2018 AGBT上宣布推出Feature Barcoding™技术。这项技术能够对研究人员感兴趣的特定生物组分以及同一细胞内无偏向的基因表达或免疫图谱进行同时分析。新技术支持广泛的研究应用,具体应用场景则取决于靶向的生物组分,包括细胞表面蛋白、T细胞受体、CRISPR介导的扰动或研究人员感兴趣的其他目标。与目前已发表的自制方法(如CITE-seq、REAP-seq、Perturb-seq和CROP-seq)相比,这项新技术将以即用型的商业化方案提供

“学术界已经提出了几种很好的方法来测定单细胞转录数据以外的新型分析物。我们是第一个即用型的商业化方案,也适合各领域研究者使用,”10x Genomics首席执行官兼联合创始人Serge Saxonov表示,“我们希望Feature Barcoding技术的这一应用及其他新型应用能够颠覆式地推动相关研究及探索。”

据悉,这项全新的Feature Barcoding技术将与其商业合作伙伴经认证的10x™兼容产品一起推出,包括适用于CRISPR应用的向导RNA产品、适用于细胞表面蛋白检测的抗体panel(BioLegend)以及适用于同时检测抗原特异性T细胞应用的dCODE™ Dextramer® panel(Immudex)。这些兼容产品可与Feature Barcoding技术和该公司的Chromium Single Cell Gene Expression或Immune Profiling Solution一起使用,提供完整、灵活的即用型解决方案,满足各领域研究人员感兴趣的特定应用。

年会上,该公司还宣布了其单细胞转录组学旗舰产品Chromium Single Cell Gene Expression Solution的重大改进。这个开创性的解决方案是第一款基于大规模并行液滴的商业化单细胞基因组学产品,也是单细胞市场上的领先产品。新版本将改善现有的单细胞基因表达分析的性能,并扩展这项技术的潜在应用,让Feature Barcoding技术等应用成为可能。

10x Genomics介绍,新产品的改进包括试剂、微流体芯片以及分析和可视化的软件工具,它们能更好地分析Feature Barcoding技术应用所产生的综合数据集。特别是Chromium Single Cell 3’ Reagent Kit (v3),它具有更高的灵敏度,能够检测更多低水平表达的基因,让研究人员能够探索和分辨其关注的细胞中的更多基因。灵敏度的提高还能帮助研究人员降低测序成本,同时满足他们对先前版本产品所期望的业界领先的性能。

据悉,10x Genomics现已接受所有发布产品的预订。Chromium Single Cell ATAC Solution预计将于2018年11月交付,而Feature Barcoding技术和改进方案将于2018年12月交付。

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本文由 SEQ.CN 作者:戴胜 发表,转载请注明来源!

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