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卢煜明教授鼻咽癌早期筛查研究最新进展,与Grail合作今年实现商业化

东南亚的鼻咽癌患病率高于世界其他地区,每十万人中约35例。若发现及时,该病的五年生存率高达95%,但如果在晚期发现,五年生存率则降至60%。然而,人们面临的难题就是大多数患者在患病早期并无症状,80%鼻咽癌患者在确诊时已经是晚期。

2017年,香港中文大学卢煜明教授的研究团队在NEJM上发表了一项2万名患者的研究,该研究采用一种基于PCR的检测方法,筛选无症状患者EB病毒的ctDNA,并在34名患者中检测出了鼻咽癌。

然而,该研究的检测方法存在两个主要问题:一是阳性预测值低二是要求病毒呈阳性的个体在四周后返回进行复查。只有在第二次检查中仍然呈阳性的患者才会进行额外的诊断检查,如MRI或内窥镜检查,但二次复查为后续大规模筛查造成了困难。此外,如果在实际的临床实践中使用该检测方法,当告诉一个人他的血液检测是阳性,且需要在四周后复查,会造成不必要的恐慌与担心,这完全违背了早期筛查的初衷。

5月15日,香港中文大学卢煜明教授研究团队发表的一项最新研究结果显示,针对EB病毒的cfDNA测序方法可鉴定出可能患有鼻咽癌的个体,相关研究已在最新一期PNAS上发表。该研究改进了卢煜明教授此前发表的检测方法,使用PCR检测EB病毒DNA,对无症状的个体转诊,进行进一步检测,据悉研究团队已经与癌症诊断初创公司Grail合作,计划今年实现该检测的商业化。

该研究仍然使用了卢煜明教授此前分析过的2万个样本。研究人员结合PCR和靶向测序方法,鉴定了鼻咽癌患者与非鼻咽癌患者之间血浆内EB病毒DNA的分子特征差异,发现鼻咽癌患者中血浆EBV病毒DNA的含量较高,且血浆病毒分子的片段长度通常比非鼻咽癌患者更长。基于研究结果,研究人员开发了一项高度准确,可通过血液筛查鼻咽癌的方法。

鼻咽癌患者和非鼻咽癌患者血浆EB病毒DNA的定量和片段大小分析

研究团队结合病毒DNA浓度和序列片段大小分析结果,最终得出靶向测序检测灵敏度为97.1%,特异性为99.3%,阳性预测值为19.6%,假阳性率显著降低。改进前的PCR检测方法阳性预测值为11%,且需要在两个时间点取样,而当在单个时间点使用时,PCR方法阳性预测值仅为3.1%。

卢教授表示,这种方法可以增强阳性预测值,并在鼻咽癌筛查中表现出优越的性能。同时,该方法也避免了后续检测对血液样本的需求,可以进行单一时间点检测。研究人员表示该方法更具临床实用性,将有助于进行鼻咽癌的大规模筛查。

基于PCR的检测方法成本更低,如在NEJM研究中,研究人员报告称,PCR检测成本仅为30美元,而内窥镜检查和MRI分别为80美元和1000美元。

对于商业化检测而言,降低成本的一种方法是将PCR和NGS测序方法结合,且可以在单一时间点抽取一次血样。初步PCR检测可筛选出近95%的被试人群,然后只有5.5%的血液样本需要继续进行下一步测序检测,这也是Grail计划用于的商业检测的策略。

卢煜明教授研究团队还在研究与人类乳头瘤病毒有关的癌症早期筛查,如宫颈癌和头颈部癌症,正在寻找类似的液体活检方法来分析血浆中的HPV。

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本文由 测序中国 作者:戴胜 发表,转载请注明来源!

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