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测序周报 · 科研篇:五篇《Nature》发出质疑,人类寿命到底有没有极限?

去年,一篇指出“人们寿命的自然极限为115岁”的文章受到了许多关注,成为了大多数主要新闻媒体的头条。爱因斯坦医学院的分子遗传学家Jan Vijg等人分析了上个世纪的全球人口统计数据,发现1970年到1990年是人类寿命延长提升的高峰期,然而到了1990年代中期和末尾,这一趋势就开始停滞。数据显示,人类的“死亡之墙”在115岁,并且125岁以上幸存的概率小于千分之一。

然而在最新一期(6月28日)Nature杂志上,五组研究人员提出了质疑,指出这一结论并不准确。

质疑声

其中一位作者,哥本哈根大学健康衰老研究中心的Maarten Pieter Rozing教授说:“这是一种极端的说法,他们认为人类的生命有限制,但我认为这种极端的说法需要再审查,应该修订为(最大年龄)随着时间的推移而逐渐增加,我们看到的下降实际上是一种基于视觉审查的杂散发现和统计。”

另外一篇文章的作者,格罗宁根大学的博士生Nick Brown则表示,这项研究的一个关键问题在于研究人员分析1995年数据时,将数据分割开来了,看到的是那一年一个可能的最大年龄,然后就用相同的数据进行了检测。“他们以为已经找到了一个模式,然后就发展出一个解释模式的理论。这样当然这些数据与理论是一致的,因为理论是从数据中产生的,这是做科学的一个很根本的错误。”

加拿大麦吉尔大学的生物学家Siegfried Hekimi说,当他和他的同事重新分析数据时,发现它实际上与多种不同的寿命轨迹一致,包括后来的寿命高峰和下降。“数据与许多其它(趋势)一致,这表明在这一时间上没有明显的寿命限制。”

另外一个方面,科学家指出在分析生命周期时,此前的研究人员只包含了任一年中最大年龄的死者,这就会产生一种“大量随机性”的小样本。

Rozing说:“可用的数据有限,因为并没有这么多超级‘人瑞’。而且我认为也没有强有力的论据证明下降。 相反我认为所有证据都指向了增加,因此我们只能等待,看看谁是正确的。”

另外两篇质疑文章也提出了类似的观点。

人类最长寿的记录由一位法国女性珍妮·路易斯·卡尔曼特( Jeanne Louise Calment)保持,她1997年过世时已经122岁了

作者的回答

原始论文的作者对此表示仍支持他们的原有结果。

Vijg说:“我认为最后还是得让数据说话,我认为我们的这些数据很有说服力。我猜许多人都无法接受是因为这指出了我们生命的终点。”

Vijg也回应了质疑文章的一些主要论点。例如,在基于数据库产生的假设,又用数据库来检测假说的这一点上,Vijg表示他的研究组实际上分析了两个独立的数据库。他补充说:“曾经一段时间,统计研究人员不希望大家去查看数据,因为他们认为这是不客观的,但是在十年前这一观点发生了改变,大家都去查看数据,作为参考,并应用正确的统计检测。”

其它的一些专家也认为这些质疑声并不能完全证明人类寿命有限的说法无效。来自伊利诺伊大学的公共卫生教授Jay Olshansky(参与了2016年的研究)说:“研究观测的现象正好就是少部分的老年人,从中得到了寿命限制的结论。质疑者认为分析分析的规模,但是他们没有意识到这不足为道。”

Olshansky说,研究的关键结论是即使未来的抗衰老干预措施能够将这一限制推翻,但人类最终还是会有一个期限。“寿命限制是115,118或120,这并不重要。重要的是我们不应该只是试图延长自己的寿命,而是应该延长健康生活的时间。”

参考资料:

Contesting the evidence for limited human Lifespan

来源:生物通

本周科研进展

1. 近日,英国桑格研究所发表在《自然.通讯》(Nature Communications)期刊上一项大规模研究发现:在医学研究中常用的实验鼠身上,性别差异对各种生理指标有着显著影响。这是当前经常被忽视的一个“盲点”,或误导当代医疗研究结果。

2. 日前,发表在《Nature》杂志上的一篇文章中,研究者们发现乳腺癌基因组的至少9个基因的启动子区域存在明显的基因突变。这一发现除了揭示更多的与乳腺癌发生有关的新型基因以外,还帮助大众了解到一类已知的基因是如何帮助乳腺肿瘤细胞逃脱治疗的。

3. 6月27日,《自然—通讯》报告了已灭绝的南美原生有蹄动物长颈驼的近乎完整的线粒体基因组。自达尔文首次发现南美原生有蹄动物化石以来,它们的演化关系就一直困扰着生物学家,但古DNA则为其带来了新的见解。

4. 日前,一项针对所有胎盘类哺乳动物祖先的染色体数字重组研究,揭示了这些紧凑的DNA与蛋白质结构,随着时间的推移已经变得混乱,这个发现也许会帮助精确地定位人类基因组中可能发生问题的位置,而其中的某些问题是构成癌症与其他疾病的基础。

5. 日本一个研究小组近日表示,他们利用基因编辑技术成功治疗了实验鼠的血友病。未来有望在此基础上开发出能根治血友病的疗法。日本自治医科大学等机构的研究人员近日在英国《科学报告》杂志上发表论文说,研究人员先培育出了基因异常的血友病实验鼠,再利用目前最热门的CRISPR/Cas9基因编辑技术,将能破坏异常基因的一种酶和正常基因导入产生凝血因子的肝脏部位,结果成功修复了异常基因,实验鼠的血友病被治愈。

6. 近日,美国科学家利用干细胞在实验室中培育出人类结肠“类器官”(HCO)。研究人员表示,分化自人类多能干细胞的胃部和小肠类器官,有望带来肠胃发育和疾病研究革命。相关成果刊登于《细胞—干细胞》期刊。

7. 近日,发表于PLOS Genetics期刊上的一项研究表明,在人类和小鼠的癌细胞基因组中,rDNA的基因拷贝数要少于正常细胞。然而,尽管拷贝数少于正常细胞,但小鼠癌细胞却表现出了更多的核糖体RNA和蛋白质合成。

8. 日前,国际小鼠表型分析联盟(IMPC)宣布了首次尝试对哺乳动物基因进行编目的研究结果。研究小组希望能够系统地构建基因敲除小鼠,进而研究每个基因的功能。最新研究结果于6月27日发表在Nature Genetics上,Smedley及其同事们已经构建了3300个用于基因研究的敲除小鼠,开发了全新的疾病模型,并发现了之前遗传机制不明的疾病相关的易感基因。

新发表文章

【新技术】

1. CrY2H-seq: a massively multiplexed assay for deep-coverage interactome mapping.Trigg SA et al.Nat Methods. 2017 Jun 26.

2. Haplotype phasing of whole human genomes using bead-based barcode partitioning in a single tube.Zhang F et al. Nat Biotechnol. 2017 Jun 26.

3. Cell type-specific transcriptome profiling in C. elegans using the Translating Ribosome Affinity Purification technique. Gracida X et al.Methods. 2017 Jun 22.

【植物】

1. Identification and Characterization of miRNA Transcriptome in Asiatic Cotton (Gossypium arboreum) Using High Throughput Sequencing. Farooq M et al. Front Plant Sci. 2017 Jun 15

2. Revisiting Pivotal-Differential Genome Evolution in Wheat.Mirzaghaderi G et al.Trends Plant Sci. 2017 Jun 22.

【微生物】

1. Community analysis of biofilms on flame-oxidized stainless steel anodes in microbial fuel cells fed with different substrates.Eyiuche NJ et al.BMC Microbiol. 2017 Jun 29

2. Relating genomic characteristics to environmental preferences and ubiquity in different microbial taxa.Cobo-Simón M et al.BMC Genomics. 2017 Jun 29

3. Microbial Eukaryote Diversity and Activity in the Water Column of the South China Sea Based on DNA and RNA High Throughput Sequencing.Xu D et al.Front Microbiol. 2017 Jun 14

4. RNA Profiling Analysis of the Serum Exosomes Derived from Patients with Active and Latent Mycobacterium tuberculosis Infection.Lv L et al.Front Microbiol. 2017 Jun 12

5. Whole Genome Sequencing Overrules a Suspected Case of Carbapenem-Resistant Enterobacter cloacae Transmission.Chen M et al. J Clin Microbiol. 2017 Jun 28.

【肿瘤】

1. IFNγ-Dependent Tissue-Immune Homeostasis Is Co-opted in the Tumor Microenvironment. Nirschl CJ et al.Cell. 2017 Jun 29

2. A gene expression signature distinguishes innate response and resistance to proteasome inhibitors in multiple myeloma.Mitra AK et al. Blood Cancer J. 2017 Jun 30

3. Integrated High Throughput Analysis Identifies GSK3 as a Crucial Determinant of p53-Mediated Apoptosis in Lung Cancer Cells.Zhang Y et al.Cell Physiol Biochem. 2017 Jun 30

4. Differential gene and lncRNA expression in the lower thoracic spinal cord following ischemia/reperfusion-induced acute kidney injury in rats.Liu QQ et al.Oncotarget. 2017 Jun 20.

5. Transcriptome profiling of cancer and normal tissues from cervical squamous cancer patients by deep sequencing.Lin W et al.Mol Med Rep. 2017 Jun 23.

6. Long non-coding RNA C5orf66-AS1 is downregulated in pituitary null cell adenomas and is associated with their invasiveness.Yu G et al.Oncol Rep. 2017 Jun 22.

7. Identification of dysregulated long non-coding RNAs/microRNAs/mRNAs in TNM I stage lung adenocarcinoma.Tian Z et al.Oncotarget. 2017 Jun 16.

【其他】

1. Intratumoral Heterogeneity of Frameshift Mutations of GLI1 Encoding a Hedgehog Signaling Protein in Colorectal Cancers.Lee JH et al. Pathol Oncol Res. 2017 Jun 29.

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本文由 测序中国 作者:陈初夏 发表,转载请注明来源!

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