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对I期CRC灵敏度达100%!FDA批准首个基于RNA的无创CRC筛查检测ColoSense

近日,胃肠道健康诊断检测开发公司Geneoscopy宣布美国FDA批准了其非侵入性结直肠癌(CRC)筛查检测ColoSense[1]。ColoSense适用于45岁或以上具有CRC典型平均风险的成年人。ColoSense被FDA指定为突破性设备,是首个利用RNA生物标志物提供疾病活动动态视图的无创性CRC筛查检测。

CRC是常见的消化道恶性肿瘤。定期筛查在发现早期CRC病变方面非常有效,并可显著提高患者生存率,但传统的影像学、结肠镜等筛查方式存在放射性损害、有创、灵敏度较低和依从性低等局限性。基于血液、尿液和粪便样本的生物标志物筛查显示出以不同灵敏度水平识别CRC的潜力。其中粪便作为消化道代谢的直接产物,在CRC相关生物标志物检测中被寄予厚望。标准粪便免疫化学检测(FIT)、粪便隐血检测(FOBT)和现有的粪便微生物标志物检测在CRC的诊断中都有着广泛应用。虽然这些方法对中晚期CRC筛查效果较好,但对于早期CRC的灵敏度仍差强人意。

图:现有CRC筛查手段的缺点。来源:Nature Communications[2]

已有研究证明,粪便来源的RNA可以作为一类有潜力的生物标志物用于无创CRC筛查。与DNA不同,RNA生物标志物可提供疾病活动的动态视图,且不受年龄相关的甲基化模式的影响。甲基化模式会导致不同年龄组之间检测性能的差异。

基于此,Geneoscopy基于多靶点粪便RNA生物标志物panel开发了ColoSense检测,用于定性检测CRC相关RNA标志物和粪便中的隐匿血红蛋白。ColoSense检测阳性结果可能提示存在CRC、晚期腺瘤或锯齿状癌前病变,建议进行结肠镜检查。
此次ColoSense成功获批的关键数据来自临床III期前瞻性研究CRC-PREVENT试验,该成果于2023年10月发表在JAMA[3]。CRC-PREVENT试验评估了ColoSense检测在来自不同种族、民族和社会背景的8920名年龄45岁及以上参与者中的应用。该试验使用一种新的分散登记方法,64%的参与者从未进行过CRC筛查,68%的参与者在登记时没有安排结肠镜检查。这与传统的集中试验不同,在传统的集中试验中,患者通常已经参与了医疗保健筛查项目。
在平均风险个体中,ColoSense检测的CRC灵敏度为94.4%,并且100%地识别I期CRC,对高度发育异常病变或至少有10个腺瘤参与者的灵敏度为65.2%。此外,ColoSense检测到45.9%的晚期腺瘤,对于尺寸超过2厘米的晚期腺瘤,灵敏度提高到50%。值得注意的是,ColoSense检测在45-49岁患者中的CRC灵敏度为100%,晚期腺瘤灵敏度为45%。

图:ColoSense检测和FIT对CRC和晚期腺瘤的敏感性和特异性,来源:JAMA[3]

在CRC中,ColoSense检测对I/II期CRC的灵敏度与对III/IV期CRC的灵敏度无显著差异。与近端病变相比,对晚期腺瘤远端病变的灵敏度显著更高(53.2% vs 37.0%)。与FIT相比,ColoSense检测CRC(94.4% vs 77.8%)和晚期腺瘤(45.9% vs 28.9%)的灵敏度显著增加。ColoSense检测的特异性或假阳性结果略低于FIT(88% vs 96%),但仍远高于FDA设定的80%的最低水平。正是基于上述研究及已有研究的良好数据结果,Geneoscopy向FDA提交了ColoSense检测的上市申请。

图:ColoSense检测和FIT对结肠镜检查中观察到病变的敏感性和特异性,来源:JAMA[3]

ColoSense是第二个获FDA批准的无创CRC筛查检测。第一个获批的是由Exact Sciences开发的Cologuard检测,于2014年批准上市。Cologuard检测是对粪便DNA和血红蛋白水平进行评估。在50岁及以上的患者中,Cologuard检测对CRC的灵敏度为92%,对晚期腺瘤的灵敏度为42%[4]。在45-49岁人群中,Cologuard检测晚期腺瘤的灵敏度为33%,没有CRC灵敏度的数据[5]。最新研究数据显示,新版本Cologuard2.0对CRC的敏感性为93.9%,对晚期癌前病变的敏感性为43.4%,对晚期瘤变的特异性为90.6%[6]。

Geneoscopy首席执行官兼联合创始人Andrew Barnell表示:“ColoSense检测获得FDA的批准标志着Geneoscopy的一个重要里程碑,表明我们的专利RNA技术可以为数百万符合条件的成年人提供一种安全有效的检测CRC和晚期腺瘤的选择。这一成就证明了我们将创新技术推向市场的坚定承诺,这将改善CRC这种致命但可预防疾病的结果。”

Fight CRC主席Anjee Davis表示:“越来越多的成年人被诊断为CRC,这突出了对创新筛查方法的迫切需求。至关重要的是消除障碍,扩大临床医生和患者筛查方法的可用性。我们希望引入FDA批准的新诊断工具,包括类似ColoSense这种基于粪便的检测,将有助于提高获得率和筛查率,最终减少晚期CRC诊断的影响。”

FDA对ColoSense的批准是促进这一CRC筛查工具供患者使用的重要一步。目前Geneoscopy正在与Labcorp合作,以在2024年晚些时候或2025年初推出其商业产品,以确保患者能够及时使用ColoSense检测进行CRC筛查。
注:ColoSense检测不能替代高风险人群的诊断性或监测性结肠镜检查。
拓展阅读

NEJM | 新一代多靶点粪便DNA检测对结直肠癌的敏感性高达93.9%!

Q3收入增长20%,Exact Sciences或于2025年推动Cologuard 2.0投入临床使用

参考资料:
1.https://www.geneoscopy.com/fda-approves-colosense-geneoscopys-noninvasive-multi-target-stool-rna-mtrna-colorectal-cancer-screening-test/
2.Wu, Y., Jiao, N., Zhu, R. et al. Identification of microbial markers across populations in early detection of colorectal cancer. Nat Commun , 2021. https://doi.org/10.1038/s41467-021-23265-y
3.Multitarget Stool RNA Test for Colorectal Cancer Screening, JAMA. 2023;330(18):1760-1768. doi:10.1001/jama.2023.22231
4.Imperiale TF , Ransohoff DF , Itzkowitz SH , et al. Multitarget stool DNA testing for colorectal-cancer screening. N Engl J Med. 2014;370(14):1287-1297. doi:10.1056/NEJMoa1311194
5.Imperiale TF , Kisiel JB , Itzkowitz SH , et al. Specificity of the multi-target stool DNA test for colorectal cancer screening in average-risk 45-49 year-olds: a cross-sectional study. Cancer Prev Res (Phila). 2021;14(4):489-496. doi:10.1158/1940-6207.CAPR-20-0294

6.BLUE-C Study Investigators. Next-Generation Multitarget Stool DNA Test for Colorectal Cancer Screening. N Engl J Med. 2024 Mar 14;390(11):984-993. doi: 10.1056/NEJMoa2310336.

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