科研

大规模癌症基因组分析提供区分脑胶质瘤新方法

超过20个研究机构的63位研究人员公布了一项包括30,000多人血液样本的大规模研究成果,通过这项分析,研究人员确定了13种胶质瘤新遗传危险因素,这揭示了增加胶质瘤易感性的个体DNA的特殊差异,同时也首次为临床医师提供了一种能区分成胶质细胞瘤和非胶质母细胞瘤等胶质瘤类型的新方法。

这一研究成果公布在3月27日的Nature Genetics杂志上。

脑胶质瘤由神经上皮细胞恶化演进形成,是成人中枢神经系统中最常见的恶性肿瘤,致死率极高,恶性脑胶质瘤5年存活期仅5%,具有浸润生长、易复发、预后差等特点。根据WHO形态学分类标准,脑胶质瘤分为四个级别和多种类型,其恶性程度不同,常规放化疗的预后差别较大,不同分型以及原发和复发胶质瘤发生发展的分子机制也有所不同,因此亟需发展针对分子病理的新的分型标准,指导临床治疗和个体化医疗,提高病人的生存期和生存质量。

文章作者,凯斯西储大学医学院综合癌症中心 Jol Barnholtz-Sloan博士说:“由于这项研究中使用的样品量很大,因此我们能第一次评估出胶质母细胞瘤与非胶质母细胞瘤的遗传风险是否不同。结果显示它们的遗传风险特征确实不同。

这项大规模研究由来自瑞典,丹麦,英国,德国,加拿大和以色列等20多个机构的63位作者完成,Barnholtz-Sloan说:“胶质瘤虽然是成年人最常见的恶性脑肿瘤类型,但样品并不容易找到,因此为了找到具有科学有效性的样本量,我们需要多机构合作。”

在新研究中,研究人员分析了多个已发表的全基因组关联研究GWAS数据。GWAS目前成为了许多实验室采用的研究工具,可以用于搜索与疾病风险相关区域的DNA序列数据。这些研究确定了患者体内的特定DNA序列分子,如G,C,T或A的变化。之前的研究曾确定了13个特殊DNA位置会增加发生胶质瘤的风险。而新研究将这个数字翻了一番,确定了另外13个新的基因位置,其中5个属于胶质母细胞瘤,8个属于非成胶质细胞瘤。

Barnholtz-Sloan说:“通过meta-analysis ,我们从最可靠的研究入手,”总共来说,这个研究小组分析了来自12,496人的胶质瘤(6,191个胶质母细胞瘤和5,819个非成胶质细胞瘤),以及18,190个无胶质瘤患者的数据。

新确定的遗传危险因素有助于区分最有可能发展成各种胶质瘤的患者。根据美国脑肿瘤协会的报道,每种肿瘤亚型都有不同的预后,最常见的是胶质母细胞瘤,仅有12-14个月的中位生存期(median survival rate)。通过这项新研究,临床医师们能够更早地诊断高危患者,从而最终改善其预后效果。

近期Nature Genetics公布了多项癌症基因组分析结果,如英国的科学家分析了来自小鼠的278个前列腺、乳腺和皮肤肿瘤的基因组,发现了数百种与PTEN有协同作用的基因,可能具有抑癌作用。

在Pten突变的转基因小鼠中,研究人员去除了其中名为Wac基因的一个拷贝,不出所料,前列腺肿瘤的体积增大了,代表Wac确实是一个抑癌基因。然而,将Wac在基因组中的两个拷贝全部删除后,令人惊讶的是肿瘤变小了。这是一个很好的治疗前列腺癌的基因靶点。PTEN相关通路的药物正在研发,然而肿瘤很快就会对这些药物产生抗性。因此,找到同时作用于其他抑癌通路的药物将有助于肿瘤治疗。我们希望在这项研究中发现的基因们可以为前列腺癌和其他癌症的治疗方法的发展提供一些思路。

另外在一项多达10万人(包括17,000名最常见类型的卵巢癌患者)的遗传分析研究中,研究人员确定了12种新的增加卵巢癌患病风险的遗传变异,并找到了它们与以前发表的18种变异之间的关联。

参考文献:

Genome-wide association study of glioma subtypes identifies specific differences in genetic susceptibility to glioblastoma and non-glioblastoma tumors

来源:生物通

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