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NGS接龙丨慧渡医疗(Predicine)CEO贾士东:从硅谷到上海,中西合璧的NGS之路

导语

9944公里,这是硅谷到上海的直线距离。美国硅谷,当今电子工业和计算机业的王国,创业者的天堂,高科技技术创新和发展的中心,该地区的风险投资占全美风险投资总额的三分之一。上海,中国的经济中心,拥有深厚的近代城市文化底蕴和众多历史古迹,亦是全球著名的的金融中心。

在美国硅谷和中国上海同步运营的慧渡医疗(Predicine)是一家专注于癌症早筛和个体化医疗的国际化高科技集团公司。公司创始人、董事长兼首席执行官贾士东博士是癌症研究领域的知名学者,任专业学术杂志Journal of Circulating Biomarkers的主编,在世界上首次发现p110b做为癌症治疗新靶点(Nature,2008)并直接推动了 p110b抑制剂的全球临床试验。今天NGS接龙的嘉宾为慧渡医疗(Predicine)的创始人贾士东博士,下面让我们一窥他中西合璧的NGS之路。

个体化治疗:二十年前的精准医疗梦

每个走上NGS道路的人都有着不同的愿景和希望,而贾士东博士的创业之路来源于二十年前读医学院时的一个困惑。那是一个典型的北方冬季,其随主治医师出呼吸科门诊、一上午看了几十位患者。贾士东博士回忆起当时的情景:“上午开的基本上都是同一类药物,严格按照老师的指导做到对症治疗,但潜意识中我感觉同一种药物不可能对每一个人都有效。”那天的经历触发了他的深层思考:临床治疗是否能因人而异、从对症下药走向个体化治疗。从那时开始,精准诊断与个体化治疗的萌芽在他的心中悄然兴起,也由此种下了20年后慧渡医疗(Predicine)的种子。

大学毕业后,他选择了考取研究生,希望通过自己的 医学科研来推动个体化临床治疗。他的研究课题是当时最为热门的分子生物学。通过当时最新科技PCR技术克隆和测序了宫颈癌相关的人乳头瘤病毒基因(HPV18)。面临更多的宫颈癌临床样本需到检测更多不同的HPV基因亚型,单基因的PCR检测能力成了技术瓶颈,这时候便产生了对多基因高通量测序的需求。

延续个体化医疗的梦想之路,贾士东博士在协和医科大学博士毕业后赴美国哈佛大学从事癌症研究。在那里,他成为哈佛医学院第一批接触到NGS技术和Celera Genomics人类基因组测序数据的科研人员。随后在美国诺华生物医学研究所(Novartis Institutes of Biomedical Research)和美国基因泰克公司(Genentech)担任实验室主任期间,贾士东博士领导的实验室有机会深入接触和进行Illumina和Ion Torrent二代测序技术的临床应用。贾博士在基因泰克的研究工作中,发现基于Ion Torrent二代测序技术的AmpliSeq (v1)测序在临床样本里会导致若干重要致癌基因(如PIK3CA)的假阳性变异。由于AmpliSeq NGS基因检测在欧美很多临床实验室已经广泛应用并被纳入英国国家健康保健系统,如果致癌基因测序结果的假阳性就会导致临床的误诊误治,严重影响个体化的临床治疗方案。为了让学术界和工业界及时了解这个重要的NGS问题,贾士东博士一方面帮助Ion Torrent解决了AmpliSeq (v1)的测序差异从而将产品升级到 AmpliSeq (v2),同时总结针对AmpliSeq (v1)的研究成果并将文章发表在具有广泛影响力的美国临床学术杂志《The Oncologist》上,及时帮助了全世界的癌症研究和NGS领域的科学家正确认知和解析二代测序在临床中的应用。

NGS:科研和生活的改造者

NGS让实现个体化治疗和精准医学成为一种可能,作为一种解读生命密码的工具,NGS技术让生命科学迈出了巨大的一步,在推动了科学的发展的同时也改变了贾士东博士的个人生活。

在世界医药行业,基因泰克公司一直被奉为学术和制药完美结合的神圣殿堂。作为基因泰克肿瘤新药临床开发中精准医疗项目的负责人,贾博士领导的前列腺癌药物精准临床试验从全球临床二期成功地进入了临床三期试验。但是基于多种RNA转录剪切变异体和基因突变导致的抗药性问题成为了前列腺癌临床药物开发中的潜在危险因素。由于前列腺癌经常发生骨转移,临床取材困难,临床急需无创伤液态活检来检测RNA转录剪切变异。目前主流的液态活检集中于对循环肿瘤DNA(ctDNA)的检测,对于血液中RNA基因变异的检测一直没有解决方案。

面对中国日益增长的癌症发病率和RNA液态活检的迫切临床需要,贾士东博士做出了一个另朋友深感意外的决定。“在回美国的飞机上,我发电子邮件辞去了在基因泰克的精准医疗和精准诊断项目负责人的职位。”贾士东博士回忆道,“做为大学同学,我的太太也很理解我的心情。她帮助我谢绝了已有的风险投资机会,把我们在硅谷的房产抵押给WellsFargo银行,支持我创办了位于硅谷的Predicine和位于上海的慧渡医疗。”

贾士东博士表示,公司的名字含义深刻,Predicine九个字母代表了公司的愿景和使命,(Predicine = Precision Diagnostics & Medicine, or Precision Medicine),通过精准诊断实现精准医疗。慧渡医疗名字中的“慧”是代表智慧医疗;“渡”代表的是远渡重洋、不仅仅让最新科技从美国来到中国,同时还能让以后在中国积累的智慧医学大数据将来走出国门,远渡重洋、进而帮助世界各地的癌症患者,从而实现慧渡医疗的初衷:In China,For Global。

“东方医学就像用望远镜看病人,而西方医学就像用显微镜看病人。精准医疗需要结合博大精深的东方智慧和精细量化的西方科学,实现医学与哲学间深度和广度的结合。”贾士东博士说。Predicine和慧渡医疗志在实现中西合璧,达到中西方智慧和文化的交汇融合。

从Predicine到慧渡医疗:横跨东西半球的创业之旅

Predicine在创立之初就吸引了来自于全球顶尖的工业界和学术界的业界精英,迅速打造了一流的研发团队。团队成员共发表200余篇专业相关文章,包括4篇第一作者Nature、Science、New England Journal of Medicine。团队在液态活检、癌症早筛、生物标记物、药物开发、生物信息学、云计算、大数据等方面积累了广泛、丰富和最前沿的第一手经验。

坚持“起点即为业界顶点”的从业标准、这家立足于癌症早筛和个体化医疗、旨在“链接患者和医疗”的国际化高科技集团公司在创立伊始就定位于解决意义重大但目前缺乏有效解决方案的临床问题、尤其是针对中国的常见癌症。贾士东博士和团队在业界首次开发出 “ctRNA+ctDNA” 联合液态活检技术:基因雷达(Gene RADAR: RNA and DNA single molecule digital Reading ),通过二代测序精准检测血液中痕量存在的游离RNA和游离DNA上的基因变异,实现了癌症DNA基因组和RNA转录组水平的联合分子检测。该技术克服了目前液态活检局限于DNA的检测困境,实现真正意义上的“全面液体活检” 、给临床癌症患者带来全新的希望。

NGS基因雷达技术的临床应用

基因雷达液态活检技术的推出,旋即引起国际药企和医疗机构的关注。慧渡医疗的团队针对中国常见肿瘤开发出包括基于二代测序的PrediScreen、PrediAct和PrediSeq在内的系列液体活检产品和服务,涵盖了癌症筛查、临床治疗和药物开发等多个领域的差异化需求。

癌症早筛。慧渡医疗(Predicine)曾率先发起了“液态活检全球合作联盟” 、旨在通过全球化、多种族、大人群的血液生物标记物来实现癌症的早期筛查和疾病监控。目前慧渡医疗已经与美国、欧洲等多家科研机构、国际药企和国内三甲医院建立业务合作,通过 PrediScreen癌症早筛项目实现对健康和癌症高危人群进行定期检测和全程健康管理。

个体化医疗。秉承“患者第一,创新驱动”的原则,慧渡医疗(Predicine)推出了针对药企和医院的PrediSeq(临床科研)和PrediAct(用药指导)的液态活检方案,实现癌症相关的疾病诊断、个体化用药指导、疗效动态监控和抗药性分析 。

中美两地的超洁分子检测实验室近期将获得国际资质金标准CAP和CLIA双重认证

新药临床试验。为帮助新药临床试验中的速度,公司推出了精准临床试验的全球解决方案。通过在美国硅谷和中国上海的国际标准实验室,利用血液样本和组织样本提供一站式精准诊断和数据分析平台全方位生物标记物检测、生物信息学和智慧医学大数据的综合分析。目前公司已经与众多药企开展全方位业务合作并支持在美国-欧洲-亚洲同步进行的国际化多中心药物临床试验。

NGS下个十年:伴随一生的基因护照或成现实

在贾士东博士看来,NGS必将在下个十年必将与人们的生活联系得更加紧密。第一,随着NGS技术的发展,技术的进步必然会带来测序速度的提高,基因检测相关服务的成本会进一步降低,人们会以更加低廉的价格享受相关服务;第二,测序的读长一定还会增加,随着技术的发展,测序在以后一定会变得更长;第三,测序数据的解读会在未来更加便捷,目前数据分析变成了一个纯粹的专业,未来数据分析会与科研及临床转化更加紧密;第四,测序仪会更加便携,手提式的测序仪会成为将来的发展方向;第五,NGS和数据分析在未来会变成智慧医疗的一部分,最终实现完全自动化,样本进入机器检测之后数据自动分析并导入大数据库,进而形成信息量庞大的智慧医学网络。人工智能和机器学习将帮助NGS应用进入寻常百姓家。基因护照或许会在将来成为现实。婴儿一出生就进行基因的检测,并在出生后的人生不同阶段进行定期的检查,建立属于自己的基因护照。通过定期的检测,每个人都可以与自己此前的基线检测结果来比较。定期的无创伤基因检测是对自身健康的最好投资。

精彩预告

讲述完贾士东博士的NGS之路,贾士东博士点名Novagene的CSO Jeff Cheng,继续讲述新的NGS故事。

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本文由 测序中国 作者:王迪 发表,转载请注明来源!

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