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开讲啦,一作!清华大学美女学霸:基于HiCDB的Hi-C相互作用域的识别与功能分析

随着基于3C技术的染色质构象技术与成像技术的迅猛发展,研究者日益认识到染色质构像在细胞周期,细胞发育分化等过程中的重要作用。Hi-C是目前研究染色质构象的最常用手段,但从Hi-C数据中得到功能性的结构却比较困难。近日,清华大学陈凤玲博士在Nucleic Acids Research发表文章“HiCDB: a sensitive and robust method for detecting contact domain boundaries”,文中介绍了一种新开发的算法HiCDB。与其他技术方法相比,HiCDB在检测各种Hi-C分辨率的相互作用域边界(CDB)方面表现出更高的灵敏度和特异性。

10月9日(今日)20:00,本论文第一作者、清华大学陈凤玲博士将亲临探基学院“开讲啦,一作!”栏目,对该研究成果进行深度解读!

01.讲师简介

陈凤玲,清华大学自动化系在读博士研究生,导师为首批千人计划特聘专家张奇伟教授。目前研究方向为:开发分析Hi-C数据的统计学算法;以Hi-C数据为中心的多组学数据整合在发育与疾病研究中的应用。

02.课程介绍

1. Hi-C数据处理的常见困惑;

2. Hi-C相互作用域的定义;

3. 多角度阐释现有算法与HiCDB的优缺点;

4. HiCDB检测的相互作用域边界功能;

5. HiCDB在差异相互作用域检测上的应用;

6. 基于染色质构象的细胞聚类。

03.报名方式

长按识别下方二维码,进入“开讲啦,一作!”直播间,即可报名免费听课!

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本文由 测序中国 作者:陈初夏 发表,转载请注明来源!

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