科研

GWAS Meta分析发现帕金森病新的候选基因

一项大型帕金森病研究结果可能找到了该疾病的新遗传途径。

来自Genentech,美国国家衰老研究所,TECNICA国际数据和23andMe的研究人员合作,为成千上万个人进行了多阶段GWAS分析和Meta分析寻找神经退行性疾病的新基因,这些人中包括帕金森病人和没有患病的。

除了已知的几十种与帕金森病有关的常见变异外,研究小组还发现了17个未被报道过的危险位点。9月11日,该研究结果在线发表在Nature Genetics上。

在第一研究阶段,研究人员分析了来自23andMe 研究项目的6476个患有帕金森病的欧洲人的基因,以及302,042个未患帕金森病的人的基因。

结果显示,12个位点的变异在帕金森病病例中的代表性较高,包括一个新的位点和多个活跃的调控标记区域。虽然有几个已知位点出现在分析中,但他们并没有看到CHMP2B基因和TMEM229B 基因与变异有显著的关系,过去曾报道这两个基因与变异有显著关系。

然后,研究小组对另外13708例病例和95282例对照进行了Meta分析,发现了35个与帕金森病有显著关联的位点。研究人员进一步对其中29个位点进行测试,测试组由5851个帕金森患者和5866个未患病的人组成。

最终,研究人员确定了17个帕金森病相关的新基因位点。有了新的风险基因位点,加上过去报道的风险位点,研究人员使用Neurocentric策略寻找候选基因,其中考虑了eQTL 数据、表达谱和神经效应相关基因。

“候选基因证实了几个已知的帕金森病的风险基因,包括GBA,LRRK2,SNCA和MAPT。”作者写道,“在41个帕金森病的风险位点中,共有29个位点有蛋白改变或者顺式eQTL变异与SNP指数相关。”

我们可以识别这些候选基因,通过研究基因功能的先后顺序确定帕金森氏病的致病基因和可能的治疗靶点。”来自Genentech的研究人员,共同资深作者Robert Graham 和Tushar Bhangale写到。

特别是,研究小组注意到,新的候选基因在溶酶体活性途径和自噬途径中都存在,也出现在线粒体通路中。

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本文由 测序中国 作者:白云 发表,转载请注明来源!

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