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百迈客生物科技产品总监刘敏|Nanopore在全长转录组研究中应用及进展

课  程  背  景

近日,Oxford Nanopore Technologies联合探基平台为大家带来国内外研究者们利用纳米孔测序进行RNA研究的系列讲座。在第七期的纳米孔转录组研究课程中,百迈客生物科技产品总监刘敏将分享百迈客基于纳米孔测序平台的实测数据及相关发现。

第七期Nanopore在全长转录组研究中应用及进展

刘敏

百迈客生物科技产品总监

  • 研究背景

全长转录组研究是理解生物机体功能的重要途径,短读长测序无法直接获得单个RNA分子由5ˊ到3ˊ的全部序列,在正确识别和定量基因的多种转录本异构体表达上局限性高。纳米孔测序无需经过片段化扩增,可直接测序天然RNA,产生横跨异构体的全长读长,可应用于定量定性分析,完善基因组注释,研究基因结构。纳米孔测序在转录测序研究与应用中有着天然的优势:

· 性价比高、通量高,转录本水平精准定量,多比对效率低

· 无需打断,可准确鉴定可变剪接、融合基因、基因家族等基因结构

· 测序读长长,无/低 GC含量特异性和碱基偏好性

从2017年3月基于纳米孔测序平台的第一个研发立项开始,百迈客生物科技一直使用Oxford Nanopore Technologies的MinION、GridION、PromethION等平台为科研技术单位及医学基因检测等机构提供优质的测序及分析服务。

基于纳米孔测序平台,百迈客测序组装超过60个物种,并且建立了完整详细的分析流程,最新一期的课程中,刘敏总监分享了

· 百迈客基于纳米孔测序平台的实测数据。

· 有趣的发现:二倍体物种,除低丰度表达基因外,其他表达基因在2G测序数据即可达到饱和。

扫描下方二维码获取纳米孔cDNA测序指南:

 报 名 方 式

注:Nanopore技术目前仅供研究使用。

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本文由 测序中国 作者:白云 发表,转载请注明来源!

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