探基

新加坡基因研究所Yue Wan | 使用直接RNA测序进行RNA结构研究

   课  程  简  介

近日,Oxford Nanopore Technologies联合探基平台为大家带来国内外研究者们利用纳米孔测序进行RNA研究的系列讲座。在第六期的纳米孔转录组研究课程中,来自新加坡基因研究所的Yue Wan将带来使用直接RNA测序进行RNA结构研究的成果。

第六期:使用直接RNA测序进行RNA结构研究

Yue Wan

新加坡基因研究所

  • 研究背景

高通量短读长测序可以同时分析数千个转录本,全球很多实验室采用该方法分析各种生物的RNA结构。然而,短读长测序与凝胶电泳法有一些相同的缺点:不能确定长RNA分子的结构、无法阐明异构体的精确结构。RNA以不同的方式存在于整个生命周期中,而批量的测序只能得到RNA分子的平均结构。此外,高通量短读长测序同样耗时长,且存在许多已知的偏差。

Yue Wan是新加坡基因组研究所的主要研究员、Branco Weiss Fellow的成员、EMBO青年研究员和Cifar Azrieli全球学者。她主要研究功能性RNA结构和了解其在细胞生物学中的作用。本次课程,带来她使用纳米孔直接RNA测序进行RNA机构研究的研究经验和成果。

  • 本期亮点

利用纳米孔长读长进行直接RNA测序,快速准确地检测RNA二级结构,并进行验证;

研究RNA的二级结构在已知RNA上的动态;

对人胚胎干细胞转录组的结构进行探测,捕获结构特征,并检测基因的各个异构体中的结构信息。

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 报 名 方 式

注:Nanopore技术目前仅供研究使用。

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本文由 测序中国 作者:陈初夏 发表,转载请注明来源!

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