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ESMO 2019丨GRAIL发布最新癌症早筛数据:利用cfDNA甲基化分析方法可溯源20余种癌症

2019年9月27日,欧洲肿瘤内科学会(ESMO)年会在西班牙巴塞罗那拉开帷幕。ESMO是欧洲最负盛名和最具影响力的肿瘤学会议,众多临床机构及领先企业在本届年会上公布了肿瘤领域的最新转化研究及临床实践数据。

9月28日,美国癌症早筛公司GRAIL在ESMO年会上重磅发布了该公司基于cfDNA的靶向甲基化液体活检分析方法在癌症早筛领域的最新研究数据。这项多中心研究结果显示,通过对cfDNA的癌症相关甲基化模式进行分析,该公司方法能够检测和定位超过20种类型的癌症,且具有较高的准确性。来自美国Dana-Farber癌症研究所的Geoffrey R. Oxnard博士在会上对最新数据进行了口头报告。

GRAIL希望在尚未出现症状的癌症患者血液中寻找肿瘤DNA的蛛丝马迹,进而对癌症进行早期筛查和诊断。为了实现该目标,GRAIL所启动的临床试验“循环游离基因组图谱研究”(Circulating Cell-free Genome Atlas,CCGA)是迄今为止规模最大的临床项目之一。在这项试验中,GRAIL使用多种策略对受试者血液样本进行分析,探索血液游离DNA表达模式和水平变化,帮助其开发癌症早筛产品。去年,该公司分别在AACR及ESMO年会上公布CCGA研究第一个预试验的研究数据,显示其基于三种原型检测技术的早筛方法在不同类型癌症具有高度特异性。此外,在今年6月的ASCO年会上,该公司数据显示,其检测方法能够在癌症早期阶段检测到12种致命癌症的强烈信号,其特异性至少达到99%,并能高精度地识别癌症的组织来源。
“大多数癌症直到晚期才被发现,而癌症仍然是全球第二大死亡原因。为了应对这一挑战,我们启动了基因组医学领域最具雄心的临床研究项目之一,以支持一种新型的泛癌种早期检测方法,”GRAIL临床开发副总裁Anne-Renee Hartman博士表示。“我们很高兴能够展示我们大规模、严密的临床研究项目的最新数据,这些数据证明我们的检测方法利用单次采血,就能够检测出各个阶段的20多种类型癌症,并确定癌症位于身体的部位,同时将假阳性降至最低。”

图:该方法检测多种类型癌症的灵敏度及特异性

据悉,在这项多中心临床试验中,研究人员对3,583份血液样本的cfDNA进行了分析,包括1,530例被诊断患有癌症患者的样本和2,053例无癌志愿者的样本。其中癌症患者的血液样本涵盖了20余种不同癌症类型,包括HR阴性乳腺癌、结直肠癌、食管癌、胆囊癌、胃癌、头颈癌、肺癌、淋巴白血病、多发性骨髓瘤、卵巢癌和胰腺癌等。研究结果显示,该方法的总体特异性为99.4%,这意味着只有0.6%的假阳性结果;总体灵敏度为54.7%(95% CI: 52.2%-57.2%)。对于预先指定的高死亡率类型癌症(约占美国癌症死亡63%的14种癌症),该方法的灵敏度为75.8%(72.9%-78.5%);I期癌症患者的灵敏度为32%,II期患者为76%,III期患者为85%,IV期患者为93%。此外,该方法还能在97%的样本中精确定位肿瘤的器官或组织来源,89%的返还结果被证明为正确溯源结果。这种跨越20余种不同肿瘤类型的精确溯源能力为简化后续诊断提供了有力保障,展示了该方法在早筛领域的广阔应用前景。

图:肿瘤组织溯源研究数据

值得关注的是,与检测DNA中的基因突变或其他癌症相关改变的液体活检方法不同,GRAIL的靶向甲基化分析方法着重于对ctDNA异常的甲基化修饰进行分析。事实证明,在许多情况下,甲基化的异常模式比突变更能说明癌症和癌症类型。该研究领导者Geoffrey Oxnard博士表示:“我们此前的工作表明,基于甲基化的检测方法在利用血液样本检测多种形式癌症上优于传统的DNA测序方法。这项最新研究结果表明,这种检测方法是筛查癌症患者的一种可行方法。”
根据GRAIL公布的信息,该公司的高效甲基化技术能够优先针对基因组信息最丰富的区域,并利用其专有的数据库和机器学习算法来检测癌症的存在并识别肿瘤的组织来源。此外,公司的癌症及非癌症甲基化特征测序数据库被认为是同类数据库中规模最大的,涵盖了整个基因组中约3000万个甲基化位点,涉及超过20种不同阶段的癌症类型。这也为该公司开发可靠的癌症甲基化分析方法提供了有力的基础。
GRAIL表示,未来该公司还将陆续发布来自其在研项目的其他新数据,相关独立验证结果将于下月进行展示。
参考资料:
1. GRAIL to Present New Data in Late-Breaking Oral Presentation at the European Society for Medical Oncology (ESMO) 2019 Congress
2. Multi-cancer detection of early-stage cancers with simultaneous tissue localization using a plasma cfDNA-based targeted methylation assay
3. New blood test capable of detecting multiple types of cancer
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本文由 测序中国 作者:戴胜 发表,转载请注明来源!

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