辨别蛛丝马迹!人工智能通过组织病理学图像预测CRC患者多组学特征及预后 | Nat Commun 白云 科研 2023-05-18 MOMA可从全切片病理图像中自动识别信息区域,而无需详细的区域级注释;其采用了视觉转换器,与标准深度学习方法相比,性能显著提高。
同时检测天然tRNA丰度和修饰谱,Nat Biotechnol发表基于纳米孔的tRNA直接测序新方法 白云 科研 2023-05-18 Nano-tRNAseq方法能够使用纳米孔DRS准确且直接地以单转录物分辨率量化tRNA丰度和修饰谱,是一种简单、稳健、有效的tRNA测序方法。
Nature | TCL1A基因异常激活可促进造血干细胞克隆扩增,有望成为预防血液肿瘤的新药物靶点 白云 科研 2023-05-18 研究团队开发了一种通过单次取样就能推断克隆扩增率的方法“PACER”,其可用于识别遗传和环境因素介导的克隆扩增,并可应用于任何组织中存在的恶性前克隆。
登陆Nature Communications-M20 Seq技术实现FFPE样本高性能检测 白云 资讯 2023-05-17 M20 Genomics团队发表了一种新的基于随机引物的高通量单细胞核测序技术snRandom-seq,并成功将其用于对FFPE样本的检测。
All of Us项目公布近25万个全基因组序列数据,旨在改变精准医疗研究范式 白云 科研 2023-05-12 美国All of Us研究项目最新发布了约25万个全基因组序列数据,用于广泛的研究用途。
NEJM | 英国“破译发育障碍”项目揭示五千余例罕见病的遗传原因 白云 科研 2023-05-12 研究团队描述了DDD研究多年来开发的分析策略。通过该项目,大约5500例严重发育障碍患者了解了其疾病相关遗传因素。
PNAS | 同时检测同一DNA分子的遗传和表观遗传特征的新方法——MethylSaferSeqS 白云 科研 2023-05-12 研究团队开发了一种称为MethylSaferSeqS的通用方法,允许检测同一DNA模板中任何类型的遗传或表观遗传变化,包括C to T转变。
TRACERx研究:利用遗传信息预测肺癌的下一步行动 白云 科研 2023-05-12 该系列研究发现有朝一日可以帮助医生利用血液检测来预测患者的癌症可能如何生长和扩散,从而实时跟踪并快速调整治疗,同时为临床医生分析术后复发风险提供了一种可能的途径。
肺癌原发及转移的多组学进化特征 | TRACERx研究Nature系列文章解读(三) 白云 科研 2023-05-12 研究发现,具有低肿瘤内变异的高表达肿瘤基因更可能处于正选择状态,这一发现可以为发现新癌症基因的研究提供思路。此外,该研究还发现在肿瘤进化中存在有限但显著的负选择。
利用ctDNA追踪早期肺癌转移扩散 | TRACERx研究Nature系列文章解读(二) 白云 科研 2023-05-12 该研究证明,术前ctDNA水平可以作为早期肺腺癌的预后指标,并揭示染色体不稳定性是该NSCLC亚型ctDNA检测的预测因子,ctDNA有望改变辅助治疗方案的设计。