思考

错过约90%的BRCA突变携带者?23andMe癌症基因检测再遭质疑

一项最新研究发现,23andMe直接面对消费者(DTC)的BRCA基因检测可能会错过约90%的BRCA突变携带者,包括有癌症家族史和没有癌症家族史的个体。此外,由于未覆盖某些突变,该检测还有可能错过德系犹太人后裔中约20%的BRCA突变。近日,在美国医学遗传学与基因组学会(ACMG)年会上,美国临床遗传学家、Invitae公司临床研究和遗传信息负责人Edward Esplin博士公布了这一结果。

Edward Esplin博士

2018年3月6日,FDA批准23andMe在无需医生处方的情况下,向消费者提供3个特定BRCA突变的基因检测服务。该产品集中检测的是德系犹太人后裔中最常见的三种BRCA突变,可用于评估女性患乳腺癌、卵巢癌的风险以及男性患乳腺癌的风险。据统计,人类共有1000多个与癌症相关的BRCA突变,23andMe采用的这三种突变不是一般人群中最常见的,但其中任何一种都会使70岁前女性患乳腺癌的几率增至45%~85%。同时,FDA在批准该产品当天发布的新闻中也提出了一些警告:鉴于该检测仅针对1000多种已知BRCA突变中的3种,所以即使检测结果为阴性,也不能排除个体携带其他突变的可能性,且该检测不能被用来替代医院的癌症筛查和遗传咨询。同时消费者和医疗保健专业人员不应直接使用该检测结果来确定任何治疗方法。

Esplin表示,到目前为止,还没有关于DTC检测对乳腺癌和卵巢癌风险检测影响的数据。该初步研究结果显示,目前DTC检测的临床效用似乎非常有限。同时他强调,该研究的目的是批评获得FDA批准的DTC检测的筛查策略,而不是批评23andMe提供的检测服务,所以研究中并没有提到23andMe的名字。

Esplin所在的研究团队正在进行的这项新研究涉及Dana-Farber癌症研究所、耶鲁大学和乔治敦大学的临床合作者。研究人员计划分析超过200,000名未经鉴定的个人基因数据,包括临床患者的小片段序列信息。在本次的ACMG报告中,Esplin给出的是该研究中3组队列的初步分析结果,研究对象为125,000名因不同原因在基因检测公司Invitae接受癌症风险诊断性检测的个体。

其中,119,300人因个人或家族癌症史被转介到Invitae进行遗传性乳腺癌和卵巢癌的诊断性基因检测。另外有5,200名没有报告其个人或家族癌症史的“健康”消费者接受了Invitae检测,因为他们想通过基因检测来了解自己的健康状况。第三个队列由100名所谓的“患者”组成,他们在收到23andMe或其他DTC检测的阳性结果后,被转介到Invitae公司进行验证性检测。

该研究发现,在基于个人或家族癌症史的队列中,11%的个体拥有致病性或可能致病性的遗传性癌症综合征相关基因突变,89%的个体检测结果为阴性。在其中4,700多名个体中,研究人员发现了致病或可能致病的BRCA1或BRCA2突变,只有12%的德系犹太人拥有三种BRCA突变中的一种,88%的个体拥有不同的变异。如果这些个体进行23andMe的基因检测,将不会获得阳性结果。在BRCA突变检测阳性的个体中,94%的个体携带一个不包括在23andMe检测中的突变,同时他们表示自己不是德系犹太人后裔。此外,在一些携带BRCA突变的德系犹太人中,23andMe的基因检测也会产生阴性结果,其中19%的基因突变在其报告的三个突变以外。

该研究中,在5,200多名“健康”个体,即没有报告个人或家族癌症史的人群中进行Invitae检测,结果没有区别。在发现携带BRCA1或BRCA2突变的个体中,只有12%是23andMe提供的三个突变中的一个,其余88%则拥有不同的突变。

此外,在转介进行验证的100名所谓的“患者”中,研究人员只能确认其中一半的DTC结果为阳性,其中多数为BRCA1或BRCA2突变。该结果与去年公布的其他研究数据一致,并指出DTC筛查可能产生假阳性结果。

需要注意的是,这100名个体中,并非所有人都进行了23andMe的DTC检测,至少有三分之一的人不是从检测中获得了阳性结果,而是通过向第三方提交原始数据进行分析获得的。Esplin表示:“我们的研究受限于临床医生提供的信息。有三分之一的病例,临床医生在检查单上报告了DTC数据的第三方分析。其余的病例,检查单上并没有第三方分析的报告,因此我们无法确定是否涉及任何第三方分析。”

Esplin表示,总体来说,该研究数据证实了FDA在批准23andMe的BRCA检测时发布的警告信息,并表明那些检测结果呈阳性以及进行有限的DTC检测结果为阴性的人需要验证性检测。这两种类型的个体都需要接受临床基因检测。

自BRCA检测产品获批以来,23andMe受到了广泛的质疑。许多专家认为,检测结果为阴性的消费者可能错误地认为他们没有乳腺癌或卵巢癌遗传风险。对此,23andMe公司表示,消费者可能在理解检测结果方面有一定的局限性,许多获得阳性结果的人可能也没有了解其他方面的基因情况。在该产品的基因健康风险报告中附带有许多警告信息,主要目的是表明该检测并不能用于医疗用途。例如,将“已知有超过1000种增加风险的基因突变”加粗显示;指出不同基因变异以及环境因素都可能影响癌症风险,有癌症家族史的人应考虑其他检查;无论三种BRCA 1/2变体中的一种呈阳性或阴性,都需要在临床中确认检测结果。

但患者可能并不了解,虽然FDA已经批准了23andMe的BRCA检测产品,但还告诉人们不要根据结果做出医疗决定,而是与医生交流并在临床进行验证性检测。也有专家认为,虽然23andMe的BRCA检测提供的基因信息非常有限,但聊胜于无。DTC基因检测是将“高高在上”的基因检测带入寻常百姓的生活,癌症风险基因检测产品的获批是这一领域迈出的重要一步。但我们也要注意到,DTC基因检测仍需在准确性和覆盖范围方面进行改进和完善。未来,DTC癌症基因检测的发展仍任重而道远。

参考资料:

1.23andMe DTC Breast and Ovarian Cancer Risk Test Misses Almost 90 Percent of BRCA Mutation Carriers

2.23andMe Health Report Concerns Linger Amid Incremental Acceptance of DTC Testing Model

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本文由 测序中国 作者:白云 发表,转载请注明来源!

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