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嘉因生物携手多伦多大学何厚胜课题组,联合推出微量RNA全转录组m6A图谱分析(MeRIP-seq)

几十年前,研究人员就发现RNA中存在着丰富的碱基修饰,但关于这些修饰的功能研究却十分有限。近年来,随着RNA m6A修饰相关的甲基化、去甲基化以及识别蛋白的相继发现,研究人员逐步意识到,RNA中的化学修饰,特别是m6A修饰是有功能的,并且在生理和病理过程中都起着重要的作用。随着研究的深入,这一领域提出了一个新的概念,即表观转录组学。对表观转录组学的研究使科研人员意识到,丰富的化学修饰改变了RNA的结构,影响其分子互补性,使得其结合特定蛋白,从而产生各种不同的生理作用。

在迄今为止发现的约150种RNA修饰中,m6A修饰是最常见、最保守,也是功能研究较多的RNA表观遗传修饰 ,它普遍存在于病毒和真核生物中。更为重要的是,这种表观遗传学修饰是可逆且动态的,即由METTL3、METTL14和 WTAP等组成的复合物介导甲基化的产生;而去甲基化的过程是由去甲基化酶FTO或ALKBH5等实现的。m6A修饰进而被特定的reader识别,从而影响各种细胞生理过程,如下图。

图:From Roadmap to the epitranscriptome

2018年9月,上海嘉因生物科技有限公司(以下简称“嘉因生物”)学术顾问、多伦多大学何厚胜教授PLOS BIOLOGY杂志上发表了题为“Refined RIP-seq protocol for epitranscriptome analysis with low input materials”的m6A实验方法学研究论文。 该论文结合了现有MeRIP-seq技术的长处,从RNA片段化的温度、RNA片段化的长度等角度优化了实验流程,使得MeRIP-seq所需总RNA起始量由300μg降低至500ng该技术的推出在一定程度上为RNA修饰进入临床研究和非人类物种的研究扫清了实验障碍,也为m6A的大样本profiling研究提供了可能。

图:何厚胜教授与嘉因生物实验团队合影

2018年11月,专注于表观遗传学的嘉因生物团队成功获得由何厚胜教授发明、多伦多大学专利保护的低起始量m6A实验专利,并于当月起正式向中国大陆提供m6A的MeRIP-seq实验服务。

嘉因生物CEO、“浦江人才”李旦博士表示,MeRIP-seq实验服务将成为嘉因生物团队继“十万样本ATAC-seq计划”之后的又一重磅产品,将与随后推出的单细胞ATAC-seq业务共同成为嘉因生物的两款新的明星产品。李旦博士强调,作为国内唯一一家同时受到来自加拿大和中国大陆的低起始量m6A实验专利保护的团队,嘉因生物将致力于服务广大中国科技工作者,与中国的研究者一起,为转录后调控的研究添砖加瓦。”

嘉因生物介绍,公司自从2014年创建以来,一直专注在表观遗传学的实验服务和分析服务上。今年8月,该公司宣布启动“十万样本开放染色质测序计划” —— ATAC-seq测序计划,引起国内外广泛关注。该计划将通过3年时间在中国建立世界领先的基因转录调控数据库,在国内和国外完成10万例样本的 ATAC-seq实验和相应的数据分析工作(点击链接,查看此前报道)。

图:嘉因生物“十万样本ATAC-seq测序计划”

嘉因生物表示,目前公司可以提供以ChIP-seq、MeRIP-Seq、ATAC-seq、单细胞ATAC-seq/单细胞RNA-seq为主的实验服务和生物信息学分析服务。截至目前,该公司已累计完成各类表观遗传学实验2000余例,ATAC-seq和组蛋白修饰的ChIP-seq成功率接近100%,转录因子ChIP-seq成功率>80%,已发表的表观遗传学相关文章的总影响因子>300分,篇数和累计影响因子均为中国大陆工业界榜首。

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