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仅需3节课!协和美女学霸带你系统学习“RNA-seq从数据分析到临床应用”

高效、快速的转录组测序(RNA测序)正在改变着人们对基因功能的认识。RNA测序能够帮助我们精确定量基因,解读基因组功能元件,获得更为全面的遗传信息。在生物学研究、医学研究、临床研究和药物研发中,RNA测序都有广泛的应用。然而,整个RNA测序和数据分析流程需要注意哪些方面?有哪些重点和难点?测序数据又如何进行分析解读?

为帮助小伙伴更全面、更系统地了解RNA测序,测序中国旗下探基平台特邀请北京协和医院杨欣壮博士,为大家带来系列课程《RNA-seq数据分析与临床应用》。经过探基小伙伴的精心准备,该系列课今晚(8月23日18:00)上线啦,快来报名听课吧!

杨欣壮 北京协和医院 博士

杨欣壮,博士,毕业于北京大学分子医学专业,生物信息方向。从事生物信息分析近十年。主要研究方向是利用二代测序技术,在基因组和转录组水平开展多种调控探究,包括遗传突变、RNA编辑、可变剪接等,以探索人类复杂疾病的发生模式。参与多项国家基金委、国家重点基础研究项目。目前已在Cell ResearchPLos GeneticsMolecular Biology Evolution,NAR等高水平杂志以第一作者或主要作者发表多篇文章。

课程概述

转录组分析是目前应用最广的高通量测序分析技术之一。常见设计是不同样品之间比较,寻找差异基因、标志基因、融合基因、RNA编辑和差异剪接等,并进行结果可视化、功能注释和网络分析等。

本课程由浅入深,从RNA文库构建方式、RNA样本数目、RNA测序量等方面的选择,到测序数据的初步分析,包括数据质控、序列比对、表达定量、差异基因、功能富集等一系列过程,杨欣壮博士将进行全面、详细的讲解。此外,杨欣壮博士对于转录组数据在临床中的应用也做了广泛扩展,以帮助大家确定研究方向。

课程安排
课程一:转录组测序概述1. 转录组测序的研究意义

2. 建库及测序方法的选择

3. 转录组数据的应用

课程二:基因差异表达分析

1. 下载、构建参考序列、序列比对

2. 表达定量、差异表达分析

3. GO、Pathway富集分析、PPI网络分析

4. miRNA、circRNA差异表达分析

课程三:RNA-seq数据的临床应用

1. 基因差异表达

2. RNA编辑

3. 可变剪接

4. 融合基因

5. RNA-seq与其它组学的联合分析

课程说明

开课时间:8月23日18:00(今晚)

授课方式:在线学习(定价19.9元/节,共3节)

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本文由 测序中国 作者:王迪 发表,转载请注明来源!

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