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跨界合作!耶鲁大学与NBA合作开展新冠病毒检测研究,验证无需RNA提取的新冠病毒唾液检测方法

连日来,美国多地疫情形势严峻,佛罗里达州、加利福尼亚州、得克萨斯州、亚利桑那州等地新增病例数持续创新高。鉴于病例数激增,美国至少23个州已宣布暂停重启经济计划。美国卫生与公众服务部助理部长Brett Giroir当地时间7月2日表示,国国内一些新冠病毒核酸检测实验室的检测能力接近上限,目前对养老院和监狱的检测力度正不断增强,而在一些疫情严重的州,核酸检测的需求量仍然巨大。实验室检测能力的限制已成为美国追踪和检测新冠病毒感染者的新障碍。

日前,耶鲁大学公共卫生学院正计划向美国食品药品监督管理局(FDA)提交一项紧急使用授权(EUA)申请,以开展一种无需RNA提取步骤的新冠病毒唾液检测方法,作为鼻咽拭子检测的替代方案。据悉,该检测方案名为“SalivaDirect”其开发者之一、耶鲁大学公共卫生学院助理研究员Anne Wyllie表示,唾液检测的侵入性相较鼻咽拭子更小,并有可能实现更高的检测结果一致性。此外,通过将一种蛋白酶添加到唾液样品中,SalivaDirect检测方法可以省掉昂贵且费时的RNA提取步骤,而这通常在RT-PCR检测方案中是必须的。

耶鲁大学研究团队目前已经向FDA提交了相关数据,并与美国国家篮球协会(NBA)和美国国家篮球运动员协会(NBPA)合作开展了一项研究,以进一步验证SalivaDirect方法的有效性。

“对于任何一项新的检测方法,最大的问题是不仅要弄清楚该方法在少数个体中效果如何,还需要在更大的人群中测试其效果如何。”Anne Wyllie表示,“通过与NBA合作,我们有机会获得了更多样本以进一步验证SalivaDirect。”据报道,NBA 在得知了耶鲁大学基于唾液的检测开发工作后,于5月中旬与该研究团队取得了联系。“他们有兴趣应用我们的检测方法,使该方法更具可扩展性、可负担性并能够向大众推广。和我们一样,他们也在考虑如何使用侵入性较小的采样方法进行筛查,并希望支持我们的研究。”

Anne Wyllie进一步介绍,NBA非常适合支持此类研究项目,因为其拥有为职业球员进行药物检测的基础设备,同时联盟也需要对球队内一直处于密切接触中的球员们进行定期的新冠病毒检测。事实上,针对NBA球员的检测正变得愈发紧迫,因为联盟自3月纷暂时停摆之后,计划于7月30日恢复赛季。犹他爵士队球员Rudy Gobert是首位COVID-19检测呈阳性的NBA球员。而随着赛季的重新开始,据报道302名NBA球员中又有16名在六月底的第一轮新冠冠状病毒检测中呈阳性。

据悉,在与耶鲁大学合作开展的这项研究中,球员的鼻咽拭子样本会被送往位于新泽西州的Secaucus Quest Diagnostics公司进行RT-PCR检测,而来自同一球员的唾液样本也将被送往耶鲁大学,以便研究人员比较两种样本类型的检测结果。一位NBA发言人表示,尽管唾液检测并没有用于这一轮测试,但22支NBA球队中有许多已经选择与耶鲁大学一起参与这项研究,但发言人拒绝透露具体的数字。发言人还表示,NBA希望为这个项目所做的贡献将有助于推动该研究中易获取的微侵入性检测的发展,但她不想推测NBA未来是否会使用这种新型唾液检测法进行检测。

根据Anne Wyllie的说法,这种基于唾液样本的检测方法对于活动性感染的检测潜力,不仅限于体育运动领域。“我们的想法是开发一种负担得起的、尽可能容易广泛应用的方案。”使用SalivaDirect方法消除了对RNA提取的需求及其相关供应链的问题,并加快了检测速度。

耶鲁大学公共卫生学院研究员Chantal Vogels还强调,其使用唾液样本进行分子检测获得的效果已经达到了与使用鼻咽拭子进行检测旗鼓相当的水平据悉,在将样品上机到RT-PCR仪进行双重测定法检测之前,其团队通过用蛋白酶k处理唾液来实现了无RNA提取的方法。“我们使用一种双重反应,而其他许多RT-PCR检测则对病毒使用单独的反应,以确保样品足以进行检测。”她补充说,在整个过程中使用更少的反应可以降低检测成本。与此同时,它还减少了试剂的使用。

事实上,试剂短缺,特别是RNA提取试剂盒的短缺是造成疫情期间检测能力不足的原因之一。尽管检测能力有所提高,但目前美国和其他地区新确诊病例的激增也凸显了大规模检测的必要性。为了缓解这一瓶颈,一些实验室也一直在研究不需要提取RNA就可以直接将样本添加到PCR反应的方法。SalivaDirect的样本采集涉及唾液收集管的使用,这些收集装置供应充足,每件成本约为0.15美元,这将有助于提高检测的总体负担能力,并有潜力使更多有症状和无症状人群尽可能接受检测。

如果耶鲁大学研究团队成功获得EUA申请,则本月晚些时候可以向公众提供高灵敏度的SalivaDirect 检测,每次检测只需2美元。与此同时,Anne Wyllie和她的同事已将无需RNA提取步骤的唾液检测方案发布到生命科学协议交互平台protocol.io,以分享其研究成果。

参考资料:
1.Yale and NBA partner to study efficacy of new COVID-19 test
https://news.yale.edu/2020/06/22/yale-and-nba-partner-study-efficacy-new-covid-19-test
2. Yale, NBA Validating RNA Extraction-Free Saliva Test for Coronavirus
https://www.genomeweb.com/infectious-disease/yale-nba-validating-rna-extraction-free-saliva-test-coronavirus#.Xv_vp3ot1PY
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本文由 测序中国 作者:陈初夏 发表,转载请注明来源!

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